重庆市中医院由原重庆市中医院和重庆市第一人民医院合并组建而成，是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型三级甲等中医医院，是卫生部国际紧急救援中心网络医院、国家爱婴医院、全国重点中西医结合医院和国家药物临床试验基地。
医院现分渝中区一号桥、小什字和道门口三地，一号桥和小什字院部将于年内搬迁到江北南桥寺，搬迁后医院将分布为南桥寺院部和道门口院部。医院业务用房面积11万平方米，开设病床1300张，设临床科室30个，
医技科室12个。有国家中医药重点学科1个（皮肤科），国家中医和中西医结合重点建设专科6个（皮肤科、神内科、针灸科、妇科、肾病科、肿瘤科），国家中医药重点研究室1个（皮肤免疫研究室），市级医学和中医药重点学（专）科9个，卫生部诊断鉴定机构2个，市级中西医结合医疗中心3个，市级研究所2个和市级临床质控中心1个。目前，重庆市中医药学会、重庆市中西医结合学会、重庆市针灸学会和重庆市中医药行业协会均挂靠在该院。
医院设有重庆市中医药文献信息中心，办有全国性刊物《中医急症杂
志》。医院有在职职工1145人，其中高级职称249人，国务院特殊津贴专家7人，重庆市学术技术带头人3人，市级名中医30人，医学博士11人，硕士81人，国家和省级师带徒导师16人，硕士研究生导师23人，国家和省级中医、中西医结合学会会长、副会长、常务理事、理事、主任委员、副主任委员42人。医院拥有大型数控放疗系统、核磁共振、螺旋CT、1000毫安多功能数字X光机、全自动生化、彩超等大型医疗设备200余台，医疗设备总值1.5亿元。年门诊量68万人次，来诊病人分布全市40个区县、市外及日本、马来西亚、加拿大等世界各地。
医院先后获国家各级科技成果奖70余项，其中“中医药治疗脑部胶质瘤的观察”获国家科技进步二等奖，“一种治疗更年期综合征的中药复方制剂及制备方法”获中华中医药学会科技发明一等奖。医院研制了参麦注射液、丹桃合剂、降糖丸、更年宁心胶囊等多个国家新药。研制了工艺独特、安全有效的院内制剂200余种。
几年来，医院先后荣获重庆市文明单位标兵，全国精神文明建设先进单位、全国卫生系统先进集体、卫生部抗震救灾先进集体、中华全国总工会工人先锋号、全国中西医结合先进单位等荣誉50多项。
