延边大学的档案工作起始于1949年3月。1958年8月，设置校档案室，于1993年3月9日升格为档案馆。从1996年4月16日新的延边大学诞生（原延边大学、延边医学院、延边农学院、吉林艺术学院延边分院、延边师范高等专科学校合并为延边大学）至2003年末的7年时间，该校档案工作的机构模式、隶属关系、投入渠道等还处于合校前的水平上，与学校事业发展的要求极不适应。2003年12月15日，校党委发布了《关于印发〈延边大学档案管理体制改革实施方案〉的通知》。根据学校的决定，于2003年12月18日实现了全校档案管理系统的实质性合并。
档案馆现有编制14人。有馆长、副馆长各一人，下设业务指导部、业务管理部、多媒体技术部等三个科级部门。目前有专职档案人员14名，其中本科学历12人、专科学历2人；副高职称5人，中级职称5人；50岁以上2人、35岁-50岁8人、35岁以下4人。其中中共正式党员10人，预备党员1人。全校共有兼职档案员188名。
档案馆馆舍（包括3个办学点档案室）总面积为550平方米，其中库房面积为320平方米，校部区已实现密集架保管档案。档案馆现有党群、行政、教学、科研、产品生产与科技开发、基建、设备、出版、外事、财会等十个种类档案近8万卷（件），另有底图600余张、照片2万余张及部分实物档案。近年来购置了计算机、查档检索机、拷贝机、刻录机、录像机、摄像机、照相机、切纸机、碎纸机、底图柜、防磁柜、扫描仪、库房消毒器、采集卡、编辑卡等39种档案加工及保管设备，基本满足了档案管理需要。
