Pusa(里海豹 Phoca caspica , 贝加尔湖海豹 Phoca sibirica 及圆海豹 Phoca hispida )及Phoca(斑海豹 Phoca largha及港海豹 Phoca vitulina)世系可能是源于中新世巴拉特提斯海(Paratethys)的海豹亚科成员 , 其它如髯海豹属 Erignathus, 管海豹属Cystophora及环海豹属Histriophoca则是源于北大西洋中部 , 且受冰川引起的海面升降压力影响而迁移至北极 , 其后更向北太平洋 , 里海及贝加尔湖等扩张 , 但更新世时期的海豹亚科成员化石太稀少 , 使了解它们的分布历史受限。值得一说的是于阿塞拜强的更新世地层也发现了拿加美海豹Necromites nestoris , 拿加美海豹Necromites nestoris是和里海豹 Phoca caspica同样生活于里海 , 拿加美海豹Necromites nestoris 具体资料不详。
早更新世的北极看似是海豹亚科基层属种髯海豹属 Erignathus及管海豹属Cystophora的发源地 , 髯海豹属 Erignathus也扩展至北大西洋及白令海 , 管海豹属Cystophora于北大西洋也有分布 , 这分布模式可解释了海豹亚科是源于北大西洋 , 在北极繁洐并向白令海扩张。髭海豹 Erignathus barbatus于日本的北海道及加拿大海湾都有分布 , 于北极的髭海豹 Erignathus barbatus有较大的体型及较厚的脂肪抵抗寒冷的海洋 。髭海豹有两个亚种包括哈德逊湾的Erignathus barbatus barbatus及拉普捷夫海(Laptev Sea)的Erignathus barbatus nauticus。于英国晚上新世至更新世早期(200万年前至180万年前)地层已发现了许多髭海豹的肱骨及胫骨化石 , 于阿拉斯加更新世中期地层也有髭海豹的化石记录 , 瑞典的晚更新世地层都有髭海豹的骨骼化石发现 , 北美东岸晚更新世至早全新世地层也有化石记录。
于2001年的摩尔多瓦中新世中期塞拉瓦尔阶Serravallian(1365 万年前至1161万年前)地层发现了环海豹属种阿里柯谢夫环海豹Histriophoca alekseevi , 阿里柯谢夫环海豹Histriophoca alekseevi是最古老的环海豹属种 , 它和现存的环海豹Histriophoca fasciata 之间存有一段长时间的真空。环海豹Histriophoca fasciata (Phoca fasciata)及琴海豹Pagophilus groenlandicus (Phoca groenlandica)的分布隔离则是由更新世时期冰川引起的海面升降所做成 , 更新世时期环海豹Histriophoca fasciata (Phoca fasciata)于北太平洋演化 , 琴海豹Pagophilus groenlandicus则是于北大西洋演化 , 于阿拉斯加早更新世地层(约200万年前)也发现了琴海豹Pagophilus groenlandicus的股骨化石 , 加拿大安大略早全新世(1万年前)地层也有琴海豹Pagophilus groenlandicus的下颌化石发现。琴海豹Pagophilus groenlandicus雄性及雌性都可长1.6米及重136公斤 , 刚出生的幼海豹有白色柔软光洁的皮毛。灰海豹 Halichoerus grypus则是从北极南部迁至气候和暖的北大西洋 , Pusa- Phoca世系及灰海豹 Halichoerus都会出没于北极的白令海。
港海豹 Phoca vitulina于更新世的间冰期分布于北极海岸线 , 持续的冰河时期减低了种内的基因交换并形成了明显的亚种 , 斑海豹 Phoca largha则是早期海豹种群的后代且于冰河时期被孤立 , 圆海豹 Phoca hispida则把其分布扩展至北极地带及大西洋至太平洋的近北极地带 , 圆海豹 Phoca hispida最古老的化石于加拿大北极群岛之一的班克斯岛(Banks Island)被发现 , 化石是属于晚更新世(41910年前) , 于魁北克早全新世(12 000–11 000 BP.) , 瑞典, 丹麦及芬兰早全新世地层都有圆海豹 Phoca hispida的化石记录。圆海豹 Phoca hispida是最细小的海豹但却是北极最常见的海豹 , 雌雄均可达1.5米及重达68公斤。里海豹 Phoca caspica则只分布于里海并和其它海豹科成员完全隔离 , 其实里海豹 Phoca caspica可能是圆海豹 Phoca hispida扩散所形成的产物 , 而分布于西伯利亚东部贝加尔湖的贝加尔湖海豹 Phoca sibirica可能也有相近的历史 , Davies于1958年也指出圆海豹 Phoca hispida于俄罗斯的拉度加湖(Lake Ladoga)及芬兰的Simaa湖都有受隔离的种群 , 这形成了一个假设 , Pusa世系源于中新世巴拉特提斯海(Paratethys)的海豹亚科成员 , 囊海豹Cryptophoca maeotica就是当地的海豹亚科成员之一 , 后来海豹亚科成员从南至北迁移并形成了北极盆地的 Pusa及Phoca世系 , 从迁移过程中遗留了一些海豹种群于内陆 , 像生活于俄国及芬兰淡水湖的圆海豹 Phoca hispida , 里海豹 Phoca caspica 及贝加尔湖海豹 Phoca sibirica就是例子了 , 但这些还需要有更多化石作研究。值得一说的是更新世已存有白鲸 , 一角鲸 ,弓头鲸及比短脸熊育空亚种要大的北极熊史前亚种残暴北极熊Ursus maritimus tyrannus和海豹亚科成员共存于北极。