取了 活体组织检查（biopsy）标本后，由活检医生将标本送至病理科进行检查。病理科医生将肉眼观察标本，再将标本置于显微镜下观察，然后将结果以病理报告的形式告诉作活检的医生。病理报告的内容包括：活检组织的外观、细胞结构、以及病理性改变或未发现病理性改变。病理报告对主管医生和病人是至关重要的，因为是否作治疗和作什么样的治疗就取决于病理报告的结果。
病理报告的第一部分是活检组织的肉眼观察。包括活检组织的全貌、活检部位、可疑 癌肿的形状、边缘是否清楚；还应叙述活检组织的大小，如直径或长度、重量（用公制单位表示，如厘米、克）。若习惯用标准计量单位，则2.5 厘米等于1英寸，454克约等于1磅。
病理报告的第二部分是叙述镜下观察到的结果。包括病理科医生在显微镜下观察到的现象，在分子水平上对活检组织进行比较专业性描述。“非典型”是一个术语，表示细胞看上去就不正常。细胞不同程度异常表现为，非典型细胞的细胞核（nucleus）比正常细胞的核大，含 染色质（chromatin）较多。 病理科医生还要观察细胞 有丝分裂的速度，其显示了细胞 增殖的迅速程度。“ 分化（Differentiation）”是又一个术语，描述细胞在某一组织内进行特殊分工，完成特定工作。细胞分化程度越低，细胞越不典型。在镜下观察时，应注意是否在活检部位将所有的异常细胞全部取下。要确定这一点，病理科医生只需在镜下观察活检组织的边缘。如果异常细胞的周围有一圈正常细胞，则该活检组织可描述为“边缘清晰”；并可认为所有的异常细胞已经去除。如果活检取下组织的边缘还有异常细胞存在，则可描述为活检组织“边缘不清”。此时，病理科医生可向主管医生建议下一步应该怎么做，比如对再次手术部位或需作其它什么治疗作出建议。
一般说来，病理报告还应有最后部分，即诊断。在这一部分，病理科医生应给出一个专业性的诊断，说明活检结果是良性（benign）还是恶性（malignant）。若是良性，病理科医生最好说明一下活检结果对病人未来健康有无预示，即取活检的肿瘤有无“恶变”的可能性。如果报告结果是恶性，病理科医生应根据对切片的观察，确定该 恶性肿瘤的严重程度。
有时，病理科医生会对主管医生建议，应再作什么样的活检，以及哪些检查结果尚待完善，哪些特异性检查可以作。所有这些都应包括在病理报告中。
