武汉工程大学审计处成立于1988年6月。审计工作一直由校长主管或由校长委托其他校领导分管，现有专职审计人员4人。十多年来，审计处一方面注意加强审计宣传，扩大审计影响，以达到对审计工作的共识。另一方面注意加强自身建设，立足于“外树形象、内强素质”，逐步树立起“高效、优质、文明、真实、客观、公正”的审计形象。2002年，审计处被教育部评为“1998-2001年全国教育审计工作先进集体”。武汉工程大学审计处紧紧围绕学校中心工作，严格审计执法。从抓制度建设入手，坚持开展财务收支审计、经济效益审计、基建和修缮工程预决算审计、领导干部任期经济责任审计，积极开展内部控制制度评审。