新疆农业大学水利与土木工程学院是新疆农业大学工科学院，建于1952年，原名八一农学院水利系。1998年更名为新疆农业大学水利与土木工程学院。学院现有农业水利工程、水利水电工程、土木工程、农业建筑环境与能源工程、工程管理和水土保持与荒漠化治理 六个本科专业，学制四年。有水利水电工程、水利水电工程管理、农田水利工程、水利工程造价管理、城镇建设、农业建筑工程、水利工程经济、水文地质与工程地质、工程测量九个专科专业 ，学制二～三年。有水利水电工程、水力学及河流动力学、水文水资源、水工结构工程、农业水土工程五个硕士研究生专业及相应工学硕士学位授权点，学制三年。还有水利水电工程博士研究生专业及相应博士学位授权点，学制三年。学院的水利水电工程学科被评为自治区重点学科。学院现有各类在校生1700余人，其中少数民族学生占30％。建院以来已培养各类水利科技人员一万余名。经过多年的教学、科研和生产实践，学院已形成了一支教学经验丰富，科研能力强，学术水平高的师资队伍。学院现有教职工89人，其中博士生导师9人，教授13人，副教授36人，有3人被国务院授予享受政府特殊津贴的专家，教师中已获工学博士学位的有3人。
学院下设农业水利工程、水利水电工程、工程测量、地下水、水力学、工程力学、建筑材料、建筑学、建筑结构 9个教研室和水工及水力学、固体力学、农业水利工程、建筑材料、岩土工程、水文水资源6个实验室，并有测量仪器室、岩石标本室、多媒体电教室、计算机室和资料情报室。学院资料情报室与国内200余家科研院所及信息服务机构建立了情报信息交流网，现有藏书5000余册，专业期刊200余种。学院有各种仪器设备300余台，计算机90台。经过50多年的奋斗，学院不仅在教学上取得了巨大的进展，而且在科研方面也形成了自己的特色，完成了多项具有影响力的科研成果，其中国家科技进步二等奖1项，获国家专利2项，获自治区科技进步一等奖1项，二等奖2项，公开出版专著教材16部。为更有效的把科研成果转化为生产力，学院1986年成立了“水利水电设计研究所”、1992年成立了“水资源服务中心”，从大大加强了科技开发、创新和推广能力。