扁鲨科仅有一属十六种 ,大多生活于气候温和的海岸及热带地域半海底上层, 尽管扁鲨科也有些体型较大的属种,但它们倾向底栖的 ,扁鲨科是不会出没于海岛旁的水域。最早的扁鲨科成员是来自晚侏罗纪的德国 , 于白垩纪及新生代大幅度扩充 ,可能来自早期超大陆的分裂从而做成地理上的分隔 , 它们于盘古大陆(Pangaean)旧海洋中大幅度扩散并做成现在的分布。
侏罗纪的扁鲨科有伪莱茵鲛属Pseudorhina , 属种包括Pseudorhina alifera 及Pseudorhinaacanthoderma二种, 对这些侏罗纪的属种认知大多数仅来自离散的牙齿化石 ,根据形态分析伪莱茵鲛Pseudorhina是被认为和扁鲨属都是单源的 , 彼此有着显著形状的舌基软骨及牙根结构 ,透过和现存的扁鲨属的骨骼形态比较 , 显示侏罗纪的扁鲨类形态和现存的扁鲨已相似得很 , 但于一些特征如眼眶结构 , 眶后突 ,筛骨区的孔位置等却有所不同。伪莱茵鲛Pseudorhina也有着现存的扁鲨属数个起源特征 ,例如有三角形及膨大的胸鳍叶,其他的特征不在此详说了。
扁鲨属可能于晚侏罗纪已存在于地球上 , 英国的侏罗纪启莫里奇阶(Kimmeridgian)地层发现的 Squatinafrequens该是最早的扁鲨属种,不过Squatinafrequens归属尚存有疑问。于白垩纪时期坎帕阶（Campanian）至麦斯特里希特阶（Maastrichtian）的欧洲及北美就生存了一种史前扁鲨属种凯斯扁鲨Squatina hassei , 凯斯扁鲨Squatina hassei牙齿只有5 mm长,牙齿两旁还长有倾斜短小的小齿尖 , 凯斯扁鲨Squatina hassei是一种细小的扁鲨类 ,于晚白垩纪的西大西洋也有凯斯扁鲨Squatinahassei的化石记录。阿尔布阶（Albian）英国及法国,森诺曼阶（Cenomanian）德国的Squatina cranei ,它的牙齿和现存的扁鲨(Squatina squatina) 相似, Squatina cranei也有部分骨骼化石被发现; Squatinadecipiens的生存年代及地域和Squatina cranei有所重叠 , 但是哈萨克土仑阶（Turonian）地层也有Squatinadecipiens的牙齿化石发现,此外阿尔布阶（Albian）英国及法国也存有另一种扁鲨属种Squatina mulleri,晚白垩纪坎帕阶(Campanian)德国的Squatina baumbergensis 则有完整的化石发现。至于古新世时期至始新世时期的扁鲨属种有Squatina prima , 它的化石于摩洛哥 , 美国切诺皮克,比利时及英国都有发现 ,化石属于古新世(达宁期Danian至塔内提阶Thanetian)至始新世伊普雷斯阶(Ypresian) , Squatinaprima有纤弱的齿冠及较低的侧翼。于渐新世至中新世有一种分布广泛的扁鲨属种Squatina subserrata ,最初被发现于中新世的奥地利 , 后来于北美马里兰州也发现了Squatina subserrata的牙齿化石 ,它的牙齿要比古新世至始新世的Squatina prima牙齿来的结实 。第三纪的扁鲨属除了Squatina subserrata,还有始新世比利时的Squatina crassa ,渐新世德国的Squatina angeloides, 加利褔亚也发现了中新世的扁鲨属种Squatina lericheii,美国约克登(YorkTown)上新世地层也发现了杜氏扁鲨(Squatina dumeril)的亲近种S. aff dumeril 牙齿化石, 上新世智利也有另一个史前扁鲨属种Squatina biforis 化石发现。 此外日本也发现了未定种的扁鲨属牙齿化石,该未定种牙齿化石是属于渐新世时期的。现存的扁鲨属种大概于中新世时期已存在 , 像非洲扁鲨(Squatinaafricana)于南非中新世至上新世地层已有化石记录 , 加州扁鲨(Squatinacalifornica)于圣地牙哥上新世地层也有化石记录 , 上述的杜氏扁鲨(Squatinadumeril)亲近种也于美国约克登上新世地层被发现。
