内蒙古医学院附属医院成立于1958年3月1日。经过50年的发展建设，目前已成为内蒙古自治区最大的一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的综合性三级甲等医院。医院开放床位1667张，年门急诊量100余万人次，住院病人5万余人次，年手术量22990人次。截止到2008年6月，医院现有职工2081名，其中专业技术人员人员1819人、管理人员58人、工勤人员205人，正高职称人员148名、副高职称人员248名，中级职称505名。博士学位人员53名。在岗护士914名，在职护理人员516人，合同护士
354人，其中主任护师1名，副主任护师21名，主管护师200名，护师211名。医院总建筑面积19万平方米。
医院设有34个临床专业科室、10个医技科室、33个行政职能和后勤部门。普通外科、神经外科、妇产科、口腔科、皮肤性病科等5个学科为自治区临床医学领先学科。神经内科、泌尿外科、血液科、医学影像科等4个学科为自治区临床医学重点学科。拥有内科学、外科学等11个硕士学位授予点。
医院不断拓展新业务新技术，在诸多领域率先开展了多项高难度、具有国内领先水平的业务——APC（氩气刀）技术治疗胃肠道隆起性病变及胃肠道出血的止血、静脉栓塞术联合硬化治疗食管胃底静脉曲张、体外受精——胚胎移植及其衍生技术、夫精人工授精技术、B超下输卵管通液、肺叶切除后支气管残端瘘的介入封堵治疗、布加氏综合征的球囊扩张及支架介入治疗技术等均填补了自治区空白。近年来医院相继成功开展了自治区首例心脏移植、背驮式肝脏移植、小肠移植以及肾脏移植、角膜移植、干细胞移植等器官移植术，其中，部分器官移植已逐渐成为常规业务。
医院拥有PET-CT、ECT、1.5T.及3.0T核磁、16层CT、Light speed 64层CT、Advantx LCV+血管机、MG SPECT、light speed RT16层大孔径定位（模拟定位机）CT 、RX/i数字胃肠机、RX/d数字X光机、彩色超声诊断仪，D93血管造影机、直线加速器、 PRK准分子激光治疗仪、全自动生化分析仪、体外循环机等价值2.68亿元的大型诊疗设备。
医院设有国内一流的ICU、CCU、干细胞移植层流病房、血液净化中心、临检中心、中心实验室、生殖中心、高压氧治疗中心、保健（体检）中心及19间现代化的层流手术间等设施。随着HIS系统、LIS系统及医生工作站——电子病历系统的上线，医院已初步实现了网络化管理。
医院坚持科技兴院的发展战略。不断健全、完善各项科研管理工作制度，加大科研投入。截至目前，医院共获国家级、自治区级科研成果160项，在专业核心刊物发表论文千余篇。
医院作为内蒙古医学院最大的临床医学教学基地，现设有16个教研室，每年承担着学院十余个专业约2400余名学生的教学任务及各临床专业硕士研究生的培养工作。此外还承担着对基层医务人员的进修、培训任务。五十年来为国家及自治区培养了数以万计的各类医学人才。
近年来，医院下大力气加强医院文化建设，着力造就一支具有较高科学文化素质、业务能力及良好职业道德的优秀医务工作者队伍。树立救死扶伤、爱岗敬业、乐于奉献、文明行医的新风尚。具有鲜明特色的院训、院徽、院旗、报纸、网站，体现出医院蓬勃向上的精神风貌和以“病人为中心”的办院宗旨。“精医厚德、福泽民众”已成为每一个附院人永恒的追求。
医院先后获得“全国爱婴医院”、“全国百佳医院”、“全国青年文明号”、“全国百姓放心示范医院”、“全国卫生系统先进集体”、“全国三八红旗集体”、“全国医院文化建设先进单位”和“全国行风建设先进集体”等荣誉称号。
医院发展目标是：建设一个具有“一流的医疗技术、一流的科研教学、一流的服务水平、一流的管理水平、一流的设施设备、一流的就医环境”的现代化医院。
