内蒙古农业大学计算机与信息工程学院于1999年7月由原内蒙古农牧学院计算机系和原内蒙古林学院基础部计算机教研室合并组建而成。原内蒙古农牧学院计算机系是在原内蒙古农牧学院计算中心的基础上成立的，于1994年开始招收计算机应用与维护专科生，于1996年建系并开始招收计算机及应用本科专业和计算机教育本科专业学生。学院现有计算机科学与技术、信息管理与信息系统、软件工程3个本科专业以及计算机应用技术硕士学位授权点。学院设有计算机公共课、计算机软件、计算机硬件3个教研室。还设有计算机基础课、计算机专业课、网络、软件工程4个院级实验室。目前在校本科学生729人，研究生18人。现有教职员工52人，教授5人，副教授11人，讲师25人，助教11人，职称结构分布合理；具有博士学位的教师4人，在职在读博士的教师4人；教师队伍获得博士、硕士人数29人,占教师总数55.8%。
承担全校现有的2000多非计算机专业研究生（1-3门课程）和校本部18000多非计算机专业所有本专科学生（2-3门）计算机公共课教学，同时承担计算机本学院1个硕士点，3个本科专业的教学工作。全院年平均承担教学工作量13000多标准学时。其中承担公共课任务占总教学工作量的57%，学院本专业的课程占总教学工作量的43%。
近3年来，教师发表论文约计140余篇。进入EI、ISTP、IEEE等系统的15篇。参加科研项目69人次，目前主持项目29项，其中国家863引导项目及省部级项目6项、厅局级项目6项、教改项目11项，校内青年基金10项，科研经费总计约90余万。学院教师有1人获得内蒙古科技进步一等奖，2人获得内蒙古科技进步三等奖，学院获得国家远程教育资源建设优秀奖，获国家专利2项。2007年该院有一名教师被评为自治区教学名师。
多年来，学院全面贯彻党的教育方针，不断进行教学的改革实践，注重培养大学生的科技创新能力。学院师生已有 3 项成果获国家专利；在自治区大学生课外学术作品竞赛和首届大学生创业计划大赛中，学生选送的多项作品获奖，取得了优异成绩。目前，计算机科学与技术专业已成为本科一批录取的专业。面对新形势，顺应 21 世纪教学改革和科学研究发展的趋势，学院将进行课程设置和教学计划的调整与整合，努力造就符合自治区经济建设和社会发展需要的高级专门人才；在全力办好本科教育的同时，积极申办研究生教育；在师资队伍建设方面，加大力度，不断提高教师的学术水平；学院近期成立应用软件研究所，实现科研与工程实践相结合，一方面为自治区经济建设作贡献，另一方面提高教师理论与实际结合的能力，进而提高教学质量，以期为国家和自治区培养更多的高质量人才。
