内蒙古自治区农业科学院前身为绥远农试场，1956年建立内蒙古自治区农业科学研究所，1984年扩建为内蒙古自治区农业科学院(处级)，1996年升级为准厅级事业科研单位（全额拨款），为内蒙古自治区级综合性农业科学研究机构，下设七个专业研究所，五个职能处室及一个专业开发机构，拥有247名高、中、初级专业人才，其中有全国、内蒙突贡各家，享受国务院政府特贴专家、科技兴区专家、深入生产第一专家、“百千万”及“321”人才工程专家多名，并涌现出了一批全国、自治区级劳动模范和各级政府表彰的科技标兵和精神文明先进个人。
单位主要工作职能是针对全区种植业生产中存在的关键科学技术问题和农业现代化的需要，在作物育种、农业生物技术应用、园艺、蔬菜、作物栽培、土壤肥料、植物保护、农产品深加工、农业经济、农业科技信息、农业与环境测试等多方面开展应用基础理论、应用技术、信息技术、加工技术和农业技术开友的研究，现主要承担国家级、自治区科技攻关、农业部重点、“夸越”、“948”、农业行业标准制定、丰收计划，国家、自治区自然科学基金等项目，同时承担国家农业开发、自治区星火、产业化、丰收计划、扶贫、成果推广项目，并开展科技下乡和农民技术培训等活动，为自治区农业科技进步和农业生产发展提供科学依据。
内蒙古自治区农业科学院四十余年来取得了296项研究成果，育出了百余个新品种，获得国家、省部级科技进步奖及推广奖122项，这些成果均已在农业生产得到了广泛应用，取得了显著的社会经济效益。
目前，内蒙古自治区农业科学院抓住内蒙古自治区种植业结构战略调整和西部大开发的机遇，积极调整学科方向，努力为自治区的农业科技进步和农业生产的发展做出新的贡献。
