合肥工业大学深圳研究院是经广东省深圳市人民政府正式批准、并于2000年6月正式在深圳市注册的事业法人单位，是合肥工业大学派出的驻校外机构。它是合肥工业大学在珠三角地区的窗口、桥梁和平台。
合肥工业大学深圳研究院主要从事人才培养、科研成果转化和在深圳兴办高新企业。
人才培养方面，根据深圳及珠三角地区的需要，研究院进行了学历和非学历、长期与短期、研究生与本科等多种形式的人才培养模式。自2000年开始招收研究生以来，先后招收了计算机科学与应用、结构工程、电气工程、工商管理硕士（MBA）等研究生和环境工程、土木工程、物流工程、电子信息工程、计算机应用等专科、专升本学员近千人。同时为适应企业发展的需要，研究院还举办了多期定单式培训项目，受到有关部门和单位的欢迎和好评。
科研成果转化方面，结合深圳市发展和企业需要，研究院一方面将学校科研成果拿到深圳来进行转化，同时针对深圳市企业提出的技术难题，学校与企业结合，联合攻关。几年来该院先后利用深圳市政策和企业资金成立了多家高新企业，均列入市高新企业，并取得良好的社会效益与经济效益。
