概述农业部南海区渔政渔港监督管理局（简称农业部南海区渔政局、南海区渔政局或南海渔政局，对外称中华人民共和国南海区渔政渔港监督管理局）是中国政府驻广州的正厅级单位，直属中华人民共和国农业部。
历史该局前身为“南海区渔业指挥部”，成立于1974年4月，直属中华人民共和国国务院、受中央军事委员会领导。
1984年5月，归属农牧渔业部，改称“农牧渔业部南海区渔政分局”，同时挂“农牧渔业部南海区渔业指挥部”牌子。
1994年12月，改为“农业部南海区渔政渔港监督管理局”，并保留“农业部南海区渔业指挥部牌子”。
2002年3月成立“珠江流域渔业管理委员会”和2003年5月成立“农业部港澳流动渔民工作协调小组”之后，加挂“珠江流域渔业管理委员会”和“农业部港澳流动渔民工作协调小组办公室”两块牌子。
2008年，改为现名。