遵义医学院基础医学院成立于2007年6月，其前身是遵义医学院基础医学部，始建于1969年，是我院最重要的教学部门之一，现有12个教研室，3个二级实验室和5个三级实验室，教职工200余名。
学院承担临床医学、口腔医学、卫生管理、医学检验、药剂药检、五官、麻醉、医学影像、临床心理、妇产、护理等普高本科专业和硕士研究生基础医学课程的教学任务，有7个硕士学位授权点，2个省级重点学科，2个校级重点学科。有省级精品课程4门，校级精品课程4门，校级优质课程1门。
学院将继续以教育部关于实施“素质教育”的指导方针和学校的办学指导思想为指导。以学科建设为龙头，以教学、科研工作为中心，以改革创新为动力，以提高教学质量为永恒主题，以培养“基础扎实、注重实效、突出创新、敬业为民”实用型人才。力争经过10-15年的努力，把基础医学院发展成整体实力比较强，基础医学学科相对齐全，亮点突出，人才结构比较合理，仪器设备较先进，部分学科在国内医学院校有一定影响力的教学型二级学院。