NPB社团法人日本棒球机构（社団法人日本野球机构；Nippon Professional Baseball，NPB）是管理日本职业棒球事务的法人机构，成立于1951年。旗下有中央联盟与太平洋联盟，共12支职棒球团加盟，该机构由日本文部科学省体育暨青少年局竞技体育课所管辖。按照日本职业棒球协约第八条第五项的规定，日本职业棒球组织的委员为该机构的会长。
前身“日本职业棒球联盟”成立于1936年，1939年改名为“日本棒球联盟”，1944年底因为第二次世界大战而停止活动，大战结束后恢复联盟运作；直到1949年底遭遇分裂危机，“日本棒球联盟”宣告解散，单一联盟时期也因此结束，进入两联盟并立的时期。
所属球队中央联盟（CENTRAL LEAGUE）:读卖巨人（东京都文京区）
东京养乐多燕子（东京都新宿区）
横滨湾星（神奈川县横滨市）
中日龙（爱知县名古屋市）
阪神虎（兵库县西宫市）
广岛东洋鲤鱼（广岛县广岛市）太平洋联盟（PACIFIC LEAGUE）:北海道日本火腿斗士（北海道札幌市）
东北乐天金鹰（宫城县仙台市）
千叶罗德海洋（千叶县千叶市）
埼玉西武狮（埼玉县所泽市）
欧力士野牛（大阪府大阪市）
福冈软件银行鹰（福冈县福冈市）
海外例行赛1940年首度前往满洲国（现在的中国东北地区）进行海外例行赛，当时全联盟九个职棒队均有参加，在7～8月间进行夏季循环赛（包含练习赛与例行赛）。原本计划1941年再举行一次，但是受到战争的影响而停止。
1961年5月20日，在当时美军占领下的冲绳岛奥武山棒球场进行西铁狮队（西武狮队前身）V.S. 东映飞人队（北海道日本火腿斗士队的前身）的比赛，为战后首度的海外例行赛。
1962年6月13日～14日，阪急勇士队（欧力士野牛队前身）与大每猎户星队（千叶罗德海洋队前身）前往冲绳岛进行海外例行赛。
2002年5月14日～15日，在台湾的台北市立天母棒球场进行福冈大荣鹰队（福冈软件银行鹰队前身）V.S. 欧力士蓝浪队（欧力士野牛队前身）的海外例行赛。
外籍球员的限制从1953年开始实施外籍球员名额限制1953年～1993年：支配下选手登录三名，一军出场登录二名。
1994年～1995年：支配下选手登录三名，一军出场登录三名。
1996年～1997年：支配下选手登录无限制，一军出场登录三名。
1998年～2001年：支配下选手登录无限制，一军出场登录四名（投手二名，野手二名）。
2002年～：支配下选手登录无限制，一军出场登录四名（投手与野手至少各一名）。
（注：支配下选手为一军与二军全体球员）
虽然不具日本国籍，但有以下情形者，视同日本籍球员：
1.在日本居住五年以上，就读日本的国中、高校、短大、专校三年以上在学者。
2.在日本居住四年以上，就读日本的大学四年以上在学者。
3.在日本居住五年以上，参加社会人球队登录三年以上者。
4.在日本职棒取得自由球员（FA）资格者，不得自行转队，但不视为外籍球员。亚洲选手名额的导入日本职棒计划于2006年导入“亚洲选手名额”，其实施的目的在于扩大亚洲各国棒球好手参加日本职棒的机会，打造日本职棒成为亚洲地区职棒界的龙头。球团方面为了征求球员工会的同意，提出以下三项条件，如果球员工会同意，则计划于2006年实施新的FA制度作为交换条件。
1.球员减薪时最大幅度为50%。
2.一、二军登录名额减为65人，增设无最低年薪保障合约的三军。
3.增设亚洲选手名额。但球员工会则提出不同要求1.球员减薪时最大幅度为40%。
2.一、二军登录名额应维持70人。
3.若要导入亚洲选手名额，仍需符合目前洋将名额登录限制。
因此，关于导入“亚洲选手名额”的时程，目前仍在研议阶段，尚无确切的实施方式与实施时间。
亚洲职棒大赛主条目：亚洲职棒大赛
为了让棒球运动更加国际化的发展，近年来亚洲各国不断出现筹组亚洲职棒联盟的构想：在原有的亚洲棒球锦标赛（两年举办一次。由各国自行征召球员组成代表队参赛，不限职棒球员，但仅限本国籍球员参赛）之外，举办亚洲区域性的职棒比赛。日本自1936年成立职棒联盟至今，已有70年历史；韩国与台湾也分别于1982年与1990年成立职棒联盟；中国至今虽无正式的职棒联盟，但亦自2002年开始举办中国棒球联赛，也初具准职棒球队雏型。
直到2005年3月22日，在日本棒球机构主导下，与韩国棒球委员会（韩国）、中华职业棒球大联盟（台湾）以及中国棒球协会的代表，于东京帝国饭店共同召开记者会，宣布将举行第一届亚洲职棒大赛，并成立执行委员会。会议中确认比赛的正式名称为“Asia Series”，参赛队伍为各国职棒联盟的年度冠军球队。
其他组织以下联盟均不属于日本棒球机构管辖：
宝冢运动协会－存在于1920年～1929年间的职棒团体。
天胜野球团－存在于1921年～1923年间的职棒团体。
国民联盟（National Baseball League）－于1947年～1949年间存在的日本职棒独立联盟，共有四支职棒球队。
全球联盟（Global League）－于1969年成立，只有存在一年的日本职棒独立联盟。
四国・九州岛联盟（Shikoku-Kyushu Island League）－从2005年起新成立的日本职棒独立联盟。
棒球挑战联盟－ 2007年所新成立的日本职棒独立联盟。
关西独立联盟－2008年所新成立的日本职棒独立联盟。
黄金联盟（Golden Baseball League）－以美国加州与亚利桑那州为根据地的日本职棒独立联盟。（参见：美国职棒独立联盟）
