马达加斯加河马是生活在马达加斯加的几个河马物种，但相信已经灭绝。它们与现存的河马及倭河马很相似。化石纪录发现马达加斯加河马的最少一个物种曾生存至一千年前，但是其他证据却显示它们有可能生存至更近的年代。这类河马的分类并不清晰，且没有广泛的研究。一般相信它们生存至全新世。
发现及分类马达加斯加河马首先是由Alfred Grandidier于1800年代中描述，他在莫桑比克海峡几里外的沼泽发掘出接近50头河马遗骸。后来不同的学者分别将之命名了4个不同的物种。其后有研究认为实际上只有两个物种，即马达加斯加侏儒河马及马达加斯加绿河马（H. madagascariensis）。于1990年发现了第三个物种，名为H. laloumena。其后发现马达加斯加绿河马与现今西非的倭河马有很多相似的地方。由于当时倭河马是分类在六齿河马属中，故其学名更名为Hexaprotodon madagascariensis。但是因一些分学家将倭河马分类到倭河马属中，马达加斯加绿河马的学名亦随之改为Choeropsis madagascariensis。
马达加斯加河马的化石纪录很丰富。当中最少有7头河马骨头上明显有被屠宰的痕迹，这显示它们生存至人类到达马达加斯加的时期。由于有被屠宰的证据，相信它们的灭绝亦与人类有关。虽然发现了大量的化石，但马达加斯加河马却没有被好好的研究，这可能是因学者对大型动物（如巨狐猴及象鸟）更有兴趣。
物种一般接受马达加斯加河马有三个物种。它们如何及何时进入马达加斯加都不得而知。有指由于河马是半水中生活，故有可能它们横渡了阔400公里的海峡而到达马达加斯加。另亦有指它们是岛上唯一的有蹄类，故有可能是一直在岛上生活或是由人类引入的。
马达加斯加侏儒河马马达加斯加侏儒河马，又名马达马加斯加黑河马，的遗骸多在马达加斯加西部的河流及湖泊发现，故它们像现今非洲的河马般生活在河岸带。马达加斯加侏儒河马的眼窝很高，方便它们在水中仍能看见。马达加斯加侏儒河马的头颅骨亦很像现今的河马，但整体大小不同，估计它们是两性异形的。
虽然马达加斯加侏儒河马是河马的亲属，但体型明显较细小，只有倭河马的大小。最大的标本只有6.5呎长及2.5呎高。它们的祖先可能是一般大小的河马，但在岛内的侏儒化而缩减了体型。
马达加斯加侏儒河马的骨头是属于1千年前。
马达加斯加绿河马马达加斯加绿河马，又名马达加斯加倭河马，原先是与马达加斯加侏儒河马一同分类在河马属中，体型亦大致一样。从马达加斯加绿河马的形态及栖息地可见，它们较为接近现今的倭河马。
就像现今的倭河马，马达加斯加绿河马的眼睛是在头部的两侧，牙齿形态亦都相同。马达加斯加绿河马亦较少在水中生活，大部份的化石都是在马达加斯加的森林高地发现。
马达加斯加绿河马及马达加斯加侏儒河马都是适于行走的，这与非洲的河马有所不同。这些共同点可见它们是从同一祖先演化而来，而与现今河马及倭河马的相似性则是因并行演化而来。
H. laloumena于1990年第三种马达加斯加河马被描述，名为Hippopotamus laloumena。对于这动物所知有限，因为它的化石只有从马达加斯加东岸马南扎里发现的一个下颌骨及肢骨。
这些化石明显是属于河马属的动物，但体型较其他的马达加斯加河马为大。唯一所知的就是它们很像现今的河马，但较为细小。
传说虽然没有发现最近1000年内马达加斯加河马的化石，但它们却在马达加斯加的口述传说中颇为普遍。于1648年，弗拉古（Étienne de Flacourt）担任马达加斯加总督时纪录了一种传说很像河马的动物。在马达加斯加不同的区域，都传说著像河马的不同动物。于1902年，一个官员称听闻在1878年的高地上仍有马达加斯加河马出没。这些传说足以令IUCN将马达加斯加河马列为近期灭绝的动物。
科学分类界：
动物界Animalia
门：
脊索动物门Chordata
纲：
哺乳动物纲 Mammalia
目：
偶蹄目Artiodactyla
科：
河马科Hippopotamidae
属及种河马属 Hippopotamus
马达加斯加侏儒河马H. lemerlei
H. laloumena
倭河马属 Choeropsis
马达加斯加绿河马C. madagascariensis
