历史渊源默克最早的起源，可以回溯到1668年时，斐德利希·杰柯·默克（Friedrich Jacob Merck）在达姆施塔特顶下一家药局。而其数代之后的子孙埃曼鲁埃尔·默克则是在1816年时继承药局的生意。在埃曼鲁埃尔与其继承人的经营下，默克慢慢成长成一家制造制药原料与其他化工制品的化学制药厂。
1891年，埃曼鲁埃尔之孙乔治·默克（George Merck）在纽约设立分公司，使得默克大药厂从此在美国生根。美国分公司初期的业务主要是自德国母公司进口化学药品，提供给其他的药师使用。随着业务日益成长，乔治在1902年时于新泽西州罗威（Rahway）正式成立Merck & Co.，开始以制造逐渐取代原本的纯进口业务。第一次世界大战期间的1917年时，默克在由美国政府充公后辅导转型成独立公司经营，自此与德国默克切断了关系。乔治除了率领默克经历了两次世界大战之外，并曾参与美国军方的研究，监督在德瑞克堡（Fort Detrick）所进行的细菌战剂研究。
1930年代初期，默克大药厂除了制药原料的生产之外，也将触角伸至药物研究的领域，并开始拓展海外市场。1953年时默克与沙东药厂（Sharp & Dohme）合并，更名为默沙东（Merck Sharp & Dohme），但在美国本土则仍采当初创厂时的原名“Merck & Co.”而不作改变。
今天，默克大药厂已经发展成为行销全球120个国家、拥有61,500名员工与31家工厂的大型跨国企业，规模甚至超出其德国前身Merck KGaA，后者拥有54个国家的销售网与28,600名员工。
2005年，年届64岁之公司董事长兼执行长雷蒙·吉马丁（Raymond Gilmartin）在该公司主动撤除关节炎治疗药物伟克适（Vioxx）的销售之后引咎辞职，由前制造部门总裁李察·克拉克（Richard Clark）接任执行长与董事长职务。
2009年3月9日默克大药厂涉资411亿美元收购先灵葆雅(Schering-Plough) 根据协议，Schering-Plough的股东每一股将可获得现金10.50美元及0.5767 默克股票。 相当于每股每股23.61美元 新公司名称为Merck。
主要药物产品Zetia（舒降之）- 依替米贝（ezetimibe]]）类药物，是一种胆固醇吸收抑制物，能降低低密度胆固醇。 Zocor（舒降之）-辛伐他汀（simvastatin）类药物，是种能降低胆固醇的他汀。 Vytorin（维妥力）– 一种与先灵葆雅（Schering-Plough，SGP）合作行销、结合舒降之与易是纯（Ezetrol，先灵葆雅所拥有的依替米贝药物）的复方降胆固醇药物。 Propecia（柔沛）与Proscar（波斯卡）：非那雄胺（finasteride）类药物，使用在掉发（雄性秃）或前列腺疾病上。 Emend（止敏吐）-阿瑞匹坦（aprepitant）类药物，一种治疗化学治疗附带的呕吐与恶心之止吐剂。 Fosamax（福善美）- 一种阿仑膦酸钠（alendronate）类药物，主要用于治疗骨质疏松症。 Singulair（欣流）- 默特路克（montelukast）类药物，可以抑制白三烯素（Leukotriene）以治疗气喘。 Crixivan（克滤满）-茚地那韦（indinavir）类药物，是一种蛋白酵素（protease）抑制剂，用于治疗爱滋病。 Maxalt（美莎）- 利扎曲坦（rizatriptan）类药物，是一种用来治疗偏头痛的曲普坦（triptans）类药物。 Cozaar（科素亚）与Hyzaar（海捷亚）-氯沙坦（losartan）类药物，用以治疗高血压并降低中风机率。 Cosopt（康舒目）- 用于治疗高眼压症、开放性青光眼、假性剥离性青光眼所造成之眼内压力过高情况。 Invanz（益满治）- 一种注射剂类型的碳青霉烯类（Carbapenem）抗生素，用于治疗中至重度的微生物感染。 Primaxin（亚胺培南（imipenem）与西司他丁（cilastatin）综合药物）–一种广用碳青霉烯类抗生素。 Gardasil（嘉喜）- 是一种四价人类乳突病毒基因重组疫苗，用以对抗人类乳突病毒（HPV），可预防生殖器疣（菜花）与子宫颈癌等病变。 Zostavax - 一种用于预防成人带状疱疹的疫苗，适用于60岁以上的成人。 Rotateq（轮达停）- 一种可以预防轮状病毒（rotavirus）所引起肠胃炎之疫苗。 ProQuad - 一种用于预防儿童罹患麻疹、腮腺炎、荨麻疹和水痘之疫苗。 Mectizan与Stromectol -伊维菌素（ivermectin）药物，主要用于治疗河盲症（river blindness）。 Zolinza - 一种Vorinostat类药物，为组蛋白去乙酰酶抑制剂，用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤（cutaneous T cell lymphoma）。 Januvia - 西他列汀（sitagliptin）类药物，是一种二肽基肽酶-4抑制剂（dipeptidyl peptidase-4 inhibitors），可用来治疗糖尿病。
伟克适1999年，美国食品药物管理局（FDA）批准了默克的治疗关节炎新药伟克适（Vioxx®，或又称为“罗菲可西保”（Rofecoxib））上市。由于伟克适的药效较强，又比较不会像传统既存的抗炎药物如能百镇（Naproxen）等，会造成服用者胃部的负担，因此俯上市不久立刻风行全球，成为最受欢迎的处方药之一。
然而，默克大药厂在产品推出后的跟踪调查中发现，与能百镇相较之下，伟克适与心脏病发作有较高的关联性。在原先的安慰剂安全性试验当中，并没有显现出如此的危险性。因此可能并不是因为伟克适增加了心脏病发作的风险，而是因为能百镇能将这样的风险降低。即使如此，默克还是在2002年修改了药品服用指示上的文字，以反映出伟克适对于心血管的潜在危险性。
获得荣誉1994年，默克大药厂被《职业妇女杂志》（Working Mothers magazine）杂志评为全球100家最佳公司之一。
相关条目依法韦仑（Efavirenz）的专利权问题
参考文献（繁体中文）台湾默克大药厂官方网站-药厂历史
