北京大学生物基础教学实验中心于1999年成立，是一个集实验课教学和实验室管理一体化的实体结构，负责全校生物基础实验教学和生物类实验室的管理。中
心将原来生命学院的所有实验室和实验课程统一管理，全面整合了实验教学内容，体现了基本实验技能的系统训练与科学研究能力培养相结合，形成了分层次、多模块、相互衔接、相对独立的实验教学新体系，同时逐步实现了实验教学内容技能化、多元化、个性化、实验教学与科研训练相互渗透的实验教学模式。
实验教学建立中心以来，利用理科基地建设项目、国家211工程、985工程、世行贷款以及学校专款集中加强了对中心的建设。先后完善了生物化学、细胞生物学、分子生物学、遗传学、微生物学、动物生物学、动物生理学、植物生物学、植物生理学等9个基础教学实验室，新建了普通生物学、发育生物学和显微互动教学实验室等3个基础教学实验室。目前，实验室使用面积由中心建设前的1411 平方米增加到2780平方米，本科教学仪器设备总值增加到1270余万元，拥有浓缩冻干仪、高速冷冻离心机、
PCR仪、凝胶成像系统、生理信号采集处理系统、荧光倒置显微镜、相差显微镜、超低温冰箱等一大批可以满足现代生物学实验需要的仪器设备。此外，生命科学学院还有1.2亿元的科研仪器可供本科学生科研训练使用。
目前，中心已成为教学体系科学、实验内容先进、实验教材系统、实验室管理规范、实验设施完善、队伍结构合理、教学效果显著，成果突出的生物基础实验教学中心，在国内发挥了良好的辐射示范作用，为国家培养了一大批高水平的生物学人才。
