东晋置。
永嘉郡前身为秦朝的闽中郡，晋明帝太宁元年（323），析临海郡南部四县置永嘉郡，属扬州，建郡治于瓯江南岸（今温州市鹿城区）。辖永宁、安固、横阳、松阳4县。相传有白鹿衔花而过，故后名鹿城。是为永嘉建郡之始。422年（南朝宁武帝永初三年）谢灵运贬至永嘉郡，遍历诸县，多有题咏，成为山水诗鼻祖。前此数年，郑缉之撰《永嘉群记》，是温州最早的地主志，今存孙诒让辑本一卷。
南朝宋元嘉末，郡属会州，孝建改元（454）属东扬州；孝建以后至齐，扬州、东扬州，屡有分并。梁末罢东扬州设缙州，废永嘉郡，陈天嘉时（560-566），东扬州、永嘉复为郡。
隋文帝开皇九年（589）平陈后，罢天下郡制，以州统县。永宁、安固、横阳、乐成四县合并，称永嘉县，属处州。592年处州改名为括州。州治设于括苍（今丽水市）。遂废永嘉郡。
炀帝大业三年（607）改州为郡，恢复永嘉郡，辖括苍、永嘉、松阳、临海4县。郡治驻括苍（丽水市区），仍属扬州。
唐高祖武德四年（621）平李子通，五年以故永嘉郡地置东嘉州，析辖永宁、安固、横阳、乐成4县。
太宗贞观元年（627）废东嘉州入括州。高宗上元二年（675），析括州之永嘉、安固二县置温州，治设永嘉（今温州市鹿城区），隶江南道。
玄宗天宝元年（742），改温州为永嘉郡，肃宗乾元元年（758）复为温州，先后隶浙江东、西道。
宋咸淳元年（1265），以度宗潜邸升温州为瑞安府。
元温州路，明清温州府。今天温州市。