西晋置。
西晋太康三年(282年)，分建安郡地设晋安郡，治所侯官县（今福州鼓楼区）隶属扬州，辖原丰、侯官、罗江、宛平、温麻、晋安、同安、新罗8县。
晋元康元年(291年)，晋安郡改隶江州(治所在豫章，今江西南昌)。
南朝宋初年，晋安郡仍隶属于江州(此时治所在柴桑，位于今九江市西南，后移治浔阳，即今九江市)。泰始四年(468年)，晋安郡改名晋平郡旋为晋平王国。不久，复名晋安郡。
梁普通六年(525年)，晋安郡属东扬州。陈永定元年(557年)，晋安郡为闽州治所。天嘉六年(565年)，撤销闽州，晋安仍属东扬州。光大二年(568年)，晋安郡为丰州治所。
隋开皇九年(589年)，晋安郡废。