清置。
清嘉庆三年(1798年)，析原福清县丞管辖的海坛岛及周围9岛置平潭建军厅，隶属于福州府。
民国2年10月，改平潭建军厅为平潭县，属东路道(民国3年，改称闽海道)。
民国14年废道，平潭县直属省辖。民国22年11月“闽变”，12月，平潭县属闽海省。
民国23年1月，“闽变”失败。7月，平潭县隶第一行政督察区。
民国36年，平潭等8县2市划属福建省直辖。
1949年9月16日，平潭解放，平潭县人民政府成立，隶福建省人民政府第四行政督察区。
1950年，平潭县隶闽侯专区。1956年，隶晋江专区。1959年，复隶闽侯专区。1971年，隶莆田地区。
1983年7月，平潭县划隶福州市。