上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身“伯特利医院”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院。2005年更名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。至今已走过八十多年辉煌的历史。
九院位于上海市中心城区黄浦区，地址：制造局路639号。东临轨道交通8号线、4号线西藏南路站，南靠中山南一路高架，与浦东隔江相望，2010年上海世博会近在咫尺，交通十分便利。是一所以口腔、整复外科和骨科为特色的内、外科为基础的具有较强综合实力的集医、教、研为一体的综合性教学三级甲等医院。九院又是上海交通大学口腔医学院和九院临床医学院教学基地。还设有上海市口腔医学研究所、上海市整复外科研究所、上海市组织工程研究中心和上海市生物材料研究测试中心。1991年来已连续六届被上海市人民政府授予市文明单位。
规模全院核定病床757张，口腔综合椅位170张。设有28个临床科室和10个医技部门。医务员工1860余人。其中副主任医师、副教授职称以上的人员300余名。现拥有3位中国工程院院士：中国工程院院士、著名整复外科专家张涤生教授，中国工程院院士、著名口腔颌面外科专家邱蔚六教授，中国工程院院士、著名骨科专家戴尅戎教授。他们曾分别创立国内3个“第一”：第一例颅颌面手术矫治先天性头颅畸形、第一例颅颌面联合根治术治疗晚期口腔颌面部恶性肿瘤、第一例定制型人工髋关节置换术。拥有著名口腔颌面外科专家、我国口腔颌面外科学创始人之一、国际牙医学院大师张锡泽教授。还拥有第一个获得美国整形外科医师协会最高奖项——詹姆斯.培雷特勃朗大奖的亚洲人、曾引起国际医学界震撼的“裸鼠背上长人耳”的国家重点基础研究规划项目（973计划）首席科学家曹谊
林教授。
九院现为上海市临床口腔医学中心、上海市整复外科临床医学中心和上海市关节外科临床医学中心建设单位。也是上海市口腔医学临床质量控制中心、上海市医疗美容质量控制中心单位。
口腔临床医学和整复外科学现为教育部高等学校重点学科。其中口腔颌面外科是上海市重点学科（优势学科）、教育部“211工程”重点建设学科；口腔内科是上海市医学领先学科、上海市医学重点学科（中西医结合黏膜病学）；口腔修复科是上海市重点学科（特色学科）；口腔正畸科是院级重点学科。整复外科是我国整复外科学的创始单位，现为国家“211工程”重点建设学科、上海市教委重点学科。骨科是上海市教委重点学科，在国际、国内享有较高声誉。血管外科、眼科、麻醉科等院级重点学科也在竞争中崛起。骨科、血管外科还列入教育部“211工程”外科学重点学科建设。
医疗近年来医院发展迅速，“十五”期间建设了16450平方米的外科综合大楼、39868平方米的口腔整复组织工程综合大楼。引进了国际一流的16层螺旋CT、1.5Ts双梯度MRI、数字化影像系统、牙科设备、激光设备、DSA、钴60、直线加速器、大型手术显微镜等先进的设施和设备。医院每天的门急诊量近4000余人次，年收治病人1.5万余人次，年施行住院手术10000余例，门诊手术22000余例。
教学九院是上海交通大学口腔医学院和临床医学院所在地，拥有27个教研室，有国内一流的投资数百万元的口腔仿真模头教学实验室。担负着本科五年制、七年制硕士、硕士研究生、博士、博士后及成人教育、高级医师进修班和全国及国外进修医师等各层次的医学教学任务，每年在九院进修学习的实习医生和学生
有500余人。设有博士研究生点5个，硕士研究生点15个，并设有博士后流动站，有博导26名，硕导60余名。
科研九院坚持“科教兴院”方针，近十年来承担科研项目500多项，其中获国家、部、市级以上的成果奖120 项，获得上海市临床医学成果奖9项，获科研经费约 9800多万元，已发表论文6000余篇。2002年度上海市高校科技统计数据显示，九院获奖成果排序在复旦大学等高校之后排名第五。2004年Medline收录论文数全国医疗机构排名第一。同时，还先后承担两期国家重大课题（组织工程基本科学问题）“973”项目、"863"子项目、国家自然科学基金重点项目、面上项目等，在国内外赢得了较高声誉，为我国卫生事业的建设和发展作出了重要贡献。
现代化的国际大都市，需要具有现代化国际医学水平和医疗服务，来提高城市综合竞争能力。面对过去我们无限自豪，憧憬未来我们信心百倍！在“三个代表”重要思想指导下，九院人同心同德、携手共进，正在满怀豪情地把九院建设成为拥有一流的学科、一流的人才、一流的学术水平、一流医疗质量、一流的医疗设施，具有时代特征、中国特色、上海特点的新九院！
