东晋置
东晋义熙七年(411年),分临淮郡置盱眙郡,治今江苏盱眙,属徐州。盱眙郡辖考城、直渎、阳城三县。
南朝宋,永初二年(421年),加徐州曰南徐州,盱眙仍为属郡,郡辖考城、直渎、阳城三县。
元嘉八年(431年)割江淮之间的地区为南兖州,盱眙郡改属南兖州。
元嘉二十八年(451年),南兖州从广陵移治盱眙。
元嘉三十年(453年),废南兖州,后复置,州治仍迁至广陵。
齐建元四年(482年),北兖州州治由淮阴迁至盱眙,盱眙郡改属北兖州。郡辖考城、盱眙、阳城、直渎、长乐五县。
梁,盱眙郡初属北兖州,后属淮州。武帝末(549年),淮南地区为东魏占领,于县治置盱眙郡,属淮州,郡辖盱眙、阳城、直渎三县”。后入北齐,盱眙郡仍属淮州,郡辖考城、盱眙、阳城、直渎四县。
陈太建五年(573年)八月,盱眙入于陈,九月改属谯州,盱眙郡仍辖考城、盱眙、阳城、直渎四县。
太建七年(575年),盱眙郡改属南兖州。后在盱眙郡治置北谯州,不久裁撤。
太建十一年(579年),盱眙郡入于周,改属扬州,郡仍辖考城、盱眙、直渎、阳城四县。
隋开皇三年(583年),废盱眙郡,考城、直渎、阳城三县并入盱眙县,属江都郡。