通州监狱始建于1951年8月，称“南通劳改支队”，隶属于南通地区专员公署公安处。下设2个大队，一大队在南通市从事手工织布（即现南通监狱前身）、二大队在“环本荡”种田，支队部设在“环本荡”。 1969年2月，整建制划给军垦，改称“中国人民解放军南京军区江苏省生产建设兵团第四师第二十二团”，在押犯和留场人员同时全部撤走。 1975年，兵团撤销，转为农垦，隶属江苏省农垦局。 1984年1月，为适应“严打”形势需要，恢复劳改建制，称“江苏省第二十一劳动改造管教支队”，隶属于南通市人民政府，1986年11月变更隶属关系，划归省劳改工作局。1994年12月更名为“江苏省通州监狱”。
江苏省通州监狱位于通州市境内，紧靠建设中的通州、如东滨海工业区，东临黄海，国家海防公路从其东部穿境而过，西接202省道，南连平海公路，距南通市区60公里，通州市区30公里，每天有班车直达金沙、南通，交通比较方便。待苏通长江大桥、崇启、崇海大桥建成后，通州监狱将进入1小时上海大都市圈。
江苏省通州监狱属省垂直管理单位，直属江苏省司法厅和江苏省监狱管理局领导。监狱工作人员即国家公务员，享受人民警察待遇。监狱人民警察的工资由省财政直拨。近年来，随着国家对监狱工作的愈加重视，监狱经费保障力度不断加大，监狱人民警察的经济待遇高于社会大多数行业。
通州监狱[1]人民警察主要从事对服刑人员的管理和教育工作，另有部分民警在机关、医院等部门工作。目前，新建的现代化监区已经启用，监狱民警的工作环境得到极大改善。
