南京红太阳种业集团公司是红太阳集团与南京市农林局合资组建的，以基因研究和利用为基础的育、繁、推一体化的国家级大型种业集团，公司以人为本，以科技为导向，致力于观念创新、技术创新、管理创新、机制创新、人才创新和市场创新，促进我国传统种业向科技型、开放型、服务型种业的迅速转化，不断提升公司在国内外市场的生命力和竞争力，力求公司高效、快速、稳定、持续的发展。
南京红太阳种业集团公司自组建以来，以科技为中心，重视人才的不断引进、开发和培养。注重培养核心竞争力，公司成立之初，就以南京植物基因公司和新纪元科技开发公司为基础组建了国内一流水平的南京植物基因工程技术中心。目前拥有国内外知名教授9名、博士3名、硕士6名，其余22名专业生物技术人员，专业从事技术研究和品种开发，充分保证了公司自有品种的不断推出和市场化运做，保证了企业的强大市场竞争力。
南京红太阳种业集团公司注重农业高新技术和高新技术产品的研究与开发，形成了以白化标记杂交育种技术、棉花无土育苗技术为核心的，以高新技术推广为核心竞争力的高效先进的产业链；形成了以抗病虫草的杂交棉（以及持续研究开发的抗病、抗盐、抗寒、抗旱杂交棉）、白化标记杂交水稻、优质高产抗逆杂交稻和常规粳稻、双低一高油菜、杂交和特种玉米以及特种蔬菜新品种为主导的多元化、系列化的优势品种。
南京红太阳种业集团公司总资产近3亿元。拥有新疆红太阳种业有限公司、四川红太阳种业有限公司、南京市种子公司等十家全资或控股子公司。同时构建了以技术、产品、利益、服务为纽带的遍布全国的稳固的市场营销体系。南京红太阳种业集团公司基础雄厚，设备先进，经过多年的不懈努力，公司已经形成研发、生产、质检、加工、营销于一体的生物高新技术企业。
南京红太阳种业集团公司2003年通过ISO9001国际质量体系认证，并被农业部评为中国种业五十强企业。踌躇满志的红太阳人以蓬勃的热情，秉承“以创新求生存、以品牌求效益、以信誉求发展”的经营理念，致力于信息国际化、技术产业化、产品标准化、市场网络化、管理科学化，孜孜追求我国21世纪高效农业的可持续发展，力争以最短的时间将红太阳种业建成产、学、研、科、工、贸于一体，融产业经营、资本经营、技术经营和人才经营的技术密集型和智慧密集型的专业化现代种业集团。
