中国科学院博士后联谊会是中国科学院各设站单位的博士后自愿组成的群众性团体，在中国科学院人事教育局、中国博士后科学基金会的指导下开展具体工作，于1996年12月正式成立。中国科学院路甬祥院长为联谊会亲笔题写会名，白春礼常务副院长为联谊会题词“立足北京，面向全国；扎根科学院，服务全社会”。
截至2007年底，我院博士后设站单位86个，科研流动站131个，约占全国流动站总数的7%，建站学科达32个。累计招收博士后7292人，当年进站博士后686人，在站博士后1747人。博士后队伍已成为我院科研一线的骨干力量、是高层次人才的重要来源。
中国科学院博士后联谊会会员由现今在站和出站的七千余名博士后组成，设有理事会，其核心力量为常务理事会。目前理事会成员主要由北京地区各个博士后设站单位选送的31名理事组成，常务理事会由理事长、副理事长等九名核心成员组成，他们是从理事会中经个人自愿、民主选举、组织考察产生，并在中国科学院人事教育局机构与岗位管理处的指导下开展日常工作。另外，专设的一名秘书长由主管部门从中国科学院在编管理人员中指定。理事长则从常务理事会中选举产生。
常务理事会下设科学发展部、学术交流部、创业服务部、信息宣传部、对外联络部、文艺体育部、秘书部等七个职能部门。理事长负责全面组织和协调工作，秘书长负责经费预算、审批、申报等工作，七名副理事长分别负责各个职能部门工作。
中国科学院博士后联谊会立足北京、面向全国；扎根科学院、服务全社会。联谊会经常性地组织各种学术交流及其它联谊活动，组织博士后向社会提供科技咨询与科技服务，并努力拓宽博士后的就业、创业、挂职、成果转化等多元化的发展渠道。期望社会各界对中科院博士后给予更多的关注和支持！
2009届现任理事长为理论物理所侯丰尧博士，秘书长是自动化所毛磊老师。 副理事长分别是王开泳博士（地理资源所）、李静博士（地理资源所）、董雪梅博士（自动化所）、张洋博士（电工所）、高洁博士（动物所）、夏鲁宁博士（研究生院）、黄喜博士（政策所）。