清乾隆二十三年（1758年）于其地筑城，定名喀喇沙尔，维吾尔语意为“黑城”。光绪八年（1882年）置喀喇沙尔直隶厅，归阿克苏道管辖。光绪二十四年（1898年），喀喇沙尔直隶厅升为焉耆府。即今新疆焉耆回族自治县。