南山区人大常委会机关的主要职责是为深圳市南山区人大常委会依法行使职权做好各项服务工作。
区人大常委会机关设一室三委。
分别为：区人大常委会办公室、区人大常委会法律工作委员会、区人大常委会财政经济工作委员会和区人大常委会教育科技文化卫生工作委员会。区依法治区工作领导小组办公室为区依法治区工作领导小组的常设办事机构，挂靠区人大常委会机关。
区人大常委会办公室是区人大常委会处理日常事务的工作与办事机构，是区人大常委会的参谋和助手。在区人大常委会和区人大常委会党组的领导下，按照服务于区人大主任会议、区人大常委会会议、区人大代表大会会议的原则，负责区人大常委会日常工作与事务的办理，保证区人大常委会各项工作协调、顺利地进行。
三个工作委员会根据分工，受主任会议的委托，为常委会审议的议案和工作报告开展调查研究，提供调查报告做好准备工作；检查法律、行政法规和全国人大及其常委会、市人大及其常委会、区人大及其常委会有关决议、决定的执行情况；承办常委会有关工作评议、述职评议的实施工作；对区政府备案的有关行政规章进行研究，提出意见；对本委员会有关的问题进行调查研究，组织代表对专门问题进行调查、座谈；组织代表对本委员会有关的问题进行视察；做好办理代表建议、批评、意见的有关工作；承办全国人大常委会、市人大常委会对有关法律草案的征求意见工作。