吉冈海底站，是北海道旅客铁道（JR北海道）海峡线沿线的铁路车站，
位于青函隧道北段上，原本是作为意外时紧急疏散用途的吉冈海底全站皆位于海床底下的地底深处，海拔负149.5米的标高使它成为全日本位置最低的铁路车站。
简介行政上位于日本北海道渡岛支厅松前郡福岛町境内的吉冈海底站，与邻近另一个海底车站龙飞海底车站（竜飞海底駅，位于青函隧道南端、青森县境内）同样都是为了作为隧道建设与营运时，容纳各式所需的机械设备，与在紧急事件发生时可以临时疏散乘车旅客的临时用车站。除此之外为了进一步利用站体设施，车站空间也被作为其他的展览用途，其中，吉冈海底站内设有海底隧道建设的相关导览和哆啦A梦广场，而龙飞海底车站则被改为海底隧道博物馆使用。每年夏季还设有特别的观光导览行程，旅客只需购买已包含车票与入场券价格在内的套票（称为“海底车站见学整理券”），就可以搭乘列车至这两个海底车站参观。
然而，伴随北海道新干线开工，需要利用海底车站的空间作为建设材料的储放空间，因此在2006年3月18日公布的列车班次表修正中，中止了所有定期列车的停站，只留特定的活动用临时列车停靠（营运期间为同年的7月15日至8月27日）。而在2006年8月27日最后一班临时特急哆啦A梦海底列车驶离吉冈海底站后，吉冈海底站的参观行程也划下了句号。至于对岸的龙飞海底车站，则继续保留作为博物馆使用。
大事记1988年3月13日 - 海峡线通车，吉冈海底站也同时启用。
2006年3月18日 - 由于北海道新干线的修筑，所有定期列车皆不再停靠此站，只有指定列车才会停站。
2006年8月27日 - 临时特急哆啦A梦海底列车停止运行，不再有列车停靠吉冈海底。
经过列车白鸟 / 超级白鸟
哆啦A梦海底列车（ドラえもん海底列车）
卧铺急行滨梨（はまなす）
卧铺特急仙后座（カシオペア）
卧铺特急黎明特快（トワイライトエクスプレス）
卧铺特急北斗星
卧铺特急榆（エルム）
