保留意见是指某个人或某些人不同意或不完全同意他人对某事物的意见和处置，但暂时不能或不愿意表达出来，也无力阻止或改变他人的意见或处置，只好自己留有对该事物的意见。
在实际审计中的保留意见是指注册会计师对被审计单位会计报表经过审计后，如果认为被审计单位会计报表的反映就其整体而言是恰当的，但还存在着下列情形之一时，注册会计师应当出具保留意见的审计报告：会计政策的选用、会计估计的作出或会计报表的披露不符合国家颁布的企业会计准则和相关会计制度的规定，虽影响重大，但不至于出具否定意见的审计报告；因审计范围受到限制，无法获取充分、适当的审计证据，虽影响重大，但不至于出具无法表示意见的审计报告。