齐齐哈尔大学农产品加工省高校重点建设实验室是2006年由省教育厅批准建设的。该重点实验室以生命科学与工程学院及玉米深加工、大豆深加工、亚麻深加工研发中心为基地，并由上述单位的教师和研究人员组成。现有40名固定人员，其中教授和研究员19人，副教授、高级工程师、高级实验师14人，具有博士学位的15人，具有硕士学位的15人。是一支实力强，结构合理、专业配套的学术研究队伍。拥有农产品加工与贮藏工程、遗传学、生物化工硕士学位授予权。
齐齐哈尔大学教授刘晓兰博士任实验室主任。该重点实验室拥有面积8000平方米，仪器设备总值达1500万元，其中10万元以上大型设备1100万元。用于农产品深加工关键技术、设备和副产品综合利用，植物蛋白资源综合开发，农产品生物技术，农产品分析检测技术，农产品采后生理及贮藏等研究工作的手段基本配套齐全，此外，还拥有中试装置，为新产品的研制开发、科研成果的转化提供了更为便利的条件。
农产品加工实验室始建于1977年，当时主要由甜菜制糖工艺实验室、分析实验室、设备实验室组成。1983年增加了食品工程实验室，1989年增加了发酵工程实验室，1991年又增加了亚麻后处理实验室。1995年起开始了玉米、大豆、亚麻、马铃薯等农产品的专项研究工作，相应的实验室也并入了其中。1998年院系调整，增加了生物科学、生物技术实验室。在上述沿革的过程中，经过学科专业调整，现农产品加工实验室下设：1、农产品深加工关键技术和设备实验室；2、植物油脂和蛋白资源综合开发实验室；3、农产品生物技术实验室；4、农产品分析检测实验室；5、农产品采后生理及贮藏实验室；6、农产品加工工程研发中心实验室。实验室隶属于齐齐哈尔大学生命科学与工程学院。
黑龙江省是我国的粮食主产区，其特点是大宗粮食多，农副产品资源丰富，开发利用潜力非常大，所表现出的科学技术工程问题也极有特色，而黑龙江省经济发展的长远战略是发展以“生态、绿色、有机”为主导的现代农业和现代食品产业，并将食品工业列为黑龙江省六大支柱产业之一，这也就是本实验室最核心的课题和基本的研究对象。近年来，本实验室在玉米综合加工技术、大豆磷脂、大豆低聚糖、葵花籽综合加工、亚麻原料生物处理的研究与开发方面做了比较系统、全面的工作。实施教学与科学研究相结合,注重科学研究与高层次创新人才培养、教师队伍建设相结合,应用基础理论与应用技术研究相结合,科学研究与产品开发相结合,开发研究与成果产业化相结合的指导思想,形成了自身的特色和优势。
