职业生涯达胡安·瓦格纳在孟菲斯大学仅打了一个赛季，就打破了单季得分纪录（762分），获得美联社全美第一阵容荣誉提名，被评选为赛区美国年度最佳新秀，美国联盟第一阵容，NABC第七赛区最佳阵容和USBWA第四赛区最佳阵容。打破了学校一个赛季投篮出手次数最高纪录（647次）。被《体育新闻》选入年度新秀最佳阵容。他是密尔特·瓦格纳的儿子，密尔特·瓦格纳曾经在路易斯维尔打球（1981-1986），并且赢得1986年全国冠军，后来成为获得1988年NBA总冠军的湖人队中的一员。在卡姆登高中的最后一年，被《今日美国》命名为年度最佳球员，获得了奈史密斯年度最佳球员奖杯。平均每场比赛得到42.5分，9次得分超过50分，以3462分成为新泽西历史上得分最多的选手。在与格罗切斯特学院的一场比赛中命中100分，在麦当劳全美比赛中投中25分，被命名为新泽西年度最佳球员。2002年选秀大会，骑士在首轮6顺位选中瓦格纳。瓦格纳凭借过人的速度和强悍的得分能力，时常被人拿来和当时如日中天的阿伦·艾弗森对比。新秀赛季，瓦格纳为骑士场均贡献13.4分和2.8助攻，不过命中率仅有36%。
他于04-05赛季患上大肠溃疡，长期腹泻，无法承受高强度比赛。终于2005年入院Mount Sinai Hospital进行大肠溃疡切除重建手术。术后不再具有NBA比赛实力，经过1年恢复，曾于2006年为金州勇士队打过一场后被裁。之后曾转战波兰，但最终也没能再复当年之勇。
个人数据NBA常规赛统计数据赛季 球队 出场 时间 投篮 三分 罚球 前场 后场 总篮板 助攻 抢断 封盖 失误 犯规 得分
02-03 骑士 47 29.5 36.9% 31.6% 80.0% 0.4 1.3 1.7 2.8 0.81 0.15 1.81 2.28 13.4
03-04 骑士 44 16.1 36.6% 36.0% 68.1% 0.2 1.1 1.3 1.2 0.59 0.16 0.93 2.02 6.5
04-05 骑士 11 9.3 32.7% 19.2% 75.0% 0.0 0.2 0.2 1.2 0.45 0.00 0.82 1.36 4.0
06-07 勇士 1 7.0 100.0% 100.0% 50.0% 0.0 0.0 0.0 1.0 0.00 0.00 1.00 1.00 4.0[1][2]大学数据赛季 球队 出场 时间 得分 投篮% 三分% 罚球% 助攻 篮板 封盖 抢断
2001-02 孟菲斯 36 31.8 21.2 41.0 31.7 72.2 3.6 2.5 0.6 1.2[3]
