1、具有两个以上遗传标记（所谓遗传标记，可以是形状、基因、位点、SSLP、SNP等等）2、连锁基础——二标记位于同一条染色体（或基因组DNA链/环）上；3、可有可无吧，距离上的一定范围（这个该不太必要）。
应该就这两个最基本了，如果你是说分析方法的前提，则见下，
噬菌体没听说过连锁分析，但想来也是个单倍体基因组的，应该差不多
1、单倍体基因组的前提：基因组可以与其他基因组交换（细菌可以转化、转导、接合，噬菌体不知道了）
2、有减数分裂过程的：要么传代周期短，要么细胞可培养，要么有家系遗传数据；（另有辐射作图法，暂不计入）
细胞器基因组（线、叶基因组）是符合条件的，唯一的问题就是基因组太小，遗传标记的分辨率太高，不过线粒体有16kb，应该是可以容下多个遗传标记了，所以结论就是，可以进行连锁分析。