滨州市疾病预防控制中心于2004年4月在原市卫生防疫站基础上组建成立的，承担着传染病、职业病、地方病、寄生虫病、慢病等疾病预防控制以及职业卫生、学校卫生、环境卫生等公共卫生工作任务，应用预防医学理论和技术，开展疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素检测与控制、实验室检测与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究等工作。是全市疾病预防控制业务指导中心，是济宁医学院、滨州医学院实践教学基地；2004年—2007年共发表学术论文49篇，获科研成果20项，其中一等奖10项。