钦州市疾病预防控制中心是在原钦州市卫生防疫站的基础上，于2003年7月11日正式成立；2003年12月16日正式独立运行。它是集疾病预防控制、监测检验与评价、健康教育与促进、技术管理与服务为一体，在同级卫生行政部门的领导下，具体实施政府对社会疾病预防控制、卫生技术管理和服务职能的公益性事业单位。全中心现有干部职工73人（含市皮防院），各级各类专业技术人员63人，占干部职工总数86.30%，其中高级技术人员5人，中级技术人员24人，分别占技术人员的7.94%和38.09%。
钦州市疾病预防控制中心在改革中主动转变观念，坚持“预防为主”的方针，积极探索疾病预防控制工作的新路子、坚持以科研为依托、以人才为根本、以疾控为中心的道路，实行科学化、规范化、制度化管理，注重人才培养、注重技术设备的更新以及工作环境条件的改善。经过全中心干部职工和全市疾控人员的共同努力，全市法定报告传染病由1982年的667.80/十万下降到2006年的76.83/十万，死亡率由3.71/十万下降到0.12/十万。近年来，先后荣获自治区党委、自治区人民政府授予“全区文明单位”、“2003年全区防治非典先进集体”、“全区强化免疫工作先进单位”和国家卫生部授予“全国消灭脊髓灰质炎先进集体”、“全国结核病防治工作先进单位”，自治区卫生厅授予“全区霍乱防治先进集体”、“全区卫生防疫防病先进集体”，市委、市政府授予“文明单位”等光荣称号。荣获自治区表彰科技成果奖6项；获自治区科委、自治区卫生厅科技进步奖8项，获市级科技进步奖6项；有56人次分别获国家卫生部、自治区、市级先进个人，有136篇论文在全国、省级、市级学术交流或专业刊物发表。
中心狠抓能力建设，努力为社会、政府和客户提供优质高效的卫生技术服务，先后投资100多万元增添了日本进口的气相色谱仪、生化仪、酶标仪和B超、心电图机、电子天平等一批仪器设备。2003年利用国债项目投资450万元，新建钦州市疾病预防控制中心重点传染病检验大楼，为进一步改善了实验室的工作环境、提高检测能力奠定了良好的基础。中心还分别于2004年10月、2005年2月、3月先后通过了自治区卫生厅和自治区质量技术监督局的预防性健康检查资质认证、计量认证复审和自治区职业技术服务资质认证的评审工作，有效地保证了检验检测结果客观、公正、准确、可靠和合法性。
