上海科学普及出版社成立于1957年，1958年曾并入上海科学技术出版社。1986年经国家新闻出版署批准复社。现为中国两家科普出版社之一，1999年被中宣部和中国科协评为中国科普工作先进集体。
上海科学普及出版社以普及科学技术知识、倡导科学方法、传播科学思想、弘扬科学精神、提高全民科学素养为己任，出版了许多科普精品图书。
重点图书《科学大师》（上下册）自2004年年初出版以来，引起各方热烈反响，受到广泛的好评。介绍著名的科学家郭申元博士的重点图书《想象拥抱的世界——郭申元博士的故事》被选入中宣部和新闻出版总署向全国青少年推荐的“百种青少年优秀图书”。“21世纪中国原创科普佳作系列”首批五种已经出版，分别是《图解现代生态学入门》、《写给小“叶永烈”》、《科学精神启示录》、《生物“芯”时代》、《宇宙文明探索》。该系列由上海市科协主席沈文庆担任编委会主任，作者有科学家、研究员、专家、教授、著名科普作家担任，内容注重原创、先进和人文特色，表述兼具通俗和趣味性。上海科学普及出版社出版的“学科故事丛书”曾在市场上畅销，受到青少年读者的广泛欢迎，目前第二辑已出版了四种，分别为《揭开生命的奥秘》、《走进深海大洋》、《探索昆虫“语言”》、《话说中国帆船》。围绕贯彻落实《全民科学素质行动计划纲要》，出版了《〈全民科学素质行动计划纲要〉解读》。《海上大师》以中国现代科学奠基者在上海的活动为线索，展示了众多自然科学和社会科学大师为开创中国现代化科学、传播科学文化所做的贡献，以纪实的笔触再现了中国现代科学史上的重要人物和重要事件。
