中国现代轨道交通科学与技术研究院于2010年4月12日在北京交通大学成立。研究院下设中国高速铁路研究中心、中国城市轨道交通研究中心、中国磁悬浮研究中心、中国管轨交通研究中心、中国综合交通研究中心，将围绕围绕交通大发展五大战略问题进行重点研究。 高速铁路研究。以轨道交通控制与安全国家重点实验室为中心，突破高速铁路的建设和运营一系列重大关键技术，特别是在高速动车组技术、高速列车控制技术、无线通信技术、牵引供电技术及综合运营调度技术等方面有重大突破。
城市轨道交通研究。以轨道交通运行控制系统国家工程研究中心为中心，开展基于通信的城轨CBTC系统、城市地下安全工程、城市轨道交通引起的环境振动及防治、城市轨道交通牵引供电系统状态监控及故障诊断、城市轨道交通能馈式牵引供电系统及牵引传动系统等技术研究，培养一批高水平的人才，为应对国家极高的城市轨道交通发展速度，提供理论、技术、标准、人才支撑。
磁悬浮研究。以磁悬浮控制系统研究团队为核心，开展基于通信的运行控制系统、中低速磁浮轨道系统试验、高速磁浮交通轨道梁动力特性、磁浮运行控制跨系统交接技术、磁浮试验线分区运行控制系统优化升级、磁浮试验线车载运行控制系统优化升级等研究，保证高速磁浮交通系统安全、高效地运行。
管轨交通研究。以管轨运行组织及管轨机电设备及管轨控制系统团队为核心，研制具有自主知识产权的管轨运输列车运行控制系统等技术。管轨运输系统是在管道中运行的直线电机轮轨运输方式，在运行控制系统研究方面还是空白。管轨运输系统列车运行控制系统是基于无线的车地通信模式，采用移动闭塞方式，对车站和区间实行一体化控制，实现管轨运输整个过程的运行控制以及自动装卸功能。
综合交通研究。以中国综合交通中心为核心，在保持铁路领域传统优势的基础上，积极拓展城市与区域交通以及公路、水运、航空、管道等领域的研究与合作，全力配合国家综合交通体系建设和交通运输系统的改革，研究相关领域内的综合交通问题，为我国综合交通系统长远发展战略研究提供政策咨询、高级人才队伍。
2020年，我国铁路营业里程将达到12.9万公里，其中客运专线达到1.6万公里以上；20多个城市将建设城市轨道交通，预计总里程达5000公里；上海至杭州的磁悬浮线路也已经得到国家有关部门的批复立项，管轨交通作为新型轨道交通方式正在研究中，预计磁悬浮和管轨交通也将得到很大的发展。未来20年，我国将成为世界轨道交通发展最快的国家。
研究院的成立旨在促进我国轨道交通自主创新能力的提升，为我国现代轨道交通发展提供政策建议、知识创新、技术支撑以及人才培养等全方位的保障。
在轨道交通科学技术方面，百年学府北京交通大学有深厚的积累和明显的优势。北京交大作为国内第一所培养铁路管理高层次人才的高校，积极承担攻关任务，为轨道交通生产实践提供技术支撑。学校现有省部级及以上科研平台28个，绝大部分平台直接或间接服务于轨道交通；8个国家级平台中，“轨道交通控制与安全国家重点实验室”、“轨道交通运行控制系统国家工程研究中心”、“电磁兼容国家认可实验室”、“结构强度检测国家认可实验室”、“高速铁路网络管理国家认可实验室”等5个直接参与轨道交通的建设与发展。近5年来，学校承担的轨道交通建设相关课题占全校科研任务的50%以上。2009年学校各类科研项目60%以上的课题与轨道交通相关，其中铁路高速、重载问题的研究比重达30%以上。
依托“轨道交通控制与安全国家重点实验室”北京交大先后研制出完全自主研发的车载信号控制系统，满足了提速列车、高速列车及重载列车等复杂条件下的信号运用要求。2004年至今，该产品共推广17000余套，应用于18个铁路局、7个地方铁路公司，覆盖全国铁路85%的机车，产品销售产值逾11亿，直接利润2.5亿，替代进口总节支约22亿元。为第五、第六次铁路大提速、长交路直达列车开行及大秦线重载列车开行提供了关键列控技术保障。2009年学校作为“复杂与高速条件下车载信号安全控制系统关键技术及应用”项目的第一主持单位，获得家科学技术进步二等奖。
近期，学校部分科研平台又承担了“高速列车运行控制系统技术及装备研制”、“高速列车运行组织方案优化设计关键技术”等科技部与铁道部联合资助的“十一五”国家科技支撑计划课题；主持“高速铁路列车运行控制系统互联互通测试与评估技术”等百万元以上铁路相关863项目近10项；积极参与“最高实验速度400KM/H高速检测列车关键技术研究与装置研制”重大专项。大量重大科研项目落户学校，显示出行业各界对学校科研平台实力稳步提升的认可。
