教育部人文社会科学重点研究基地福建师范大学闽台区域研究中心，属教育部人文社会科学重点研究基地。
中心的历史可以追溯到20世纪50年代，早在1958年福建师范大学的前身福建师范学院就成立了福建地方史研究室。
此后，相继成立了中外关系史研究室、华侨史研究室等。1989年6月，成立福建文化研究所。1994年之后，又相继成立中琉历史关系研究所、宗教文化研究所、闽台文化研究所、华人华侨研究中心等。1998年成立台湾研究中心，下设5个研究所。
1999年10月，为了加大对闽台区域的研究力度，更好地为祖国统一大业服务，成立福建师范大学闽台区域研究中心，对科研人员进行优化组合，改革管理体制，争取将研究中心建成全国一流的研究基地。
2001年4月，本研究中心被教育部正式批准为省属高校人文社会科学重点研究基地。本研究中心的宗旨是以闽台经济研究为龙头，以闽台海上交通研究为支柱，以闽台文化研究为基础，注重历史，面向现实，放眼未来，为早日实现海峡两岸"三通"、完成祖国统一大业服务。
