电子通关概念采用网络信息技术，将检验检疫机构签发的出入境通关单的电子数据传输到海关计算机业务系统，海关将报检报关数据比对确认相符合，予以放行，这种通关形式叫电子通关。
电子通关的意义（1）为了确保检验检疫机构对出入境货物的监管有效、方便进出，加快进出口货物通关速度，国家质检总局和海关总署开发了电子通关单联网核查系统，已于2003年1月1日在主要口岸的检验检疫机构和海关推广应用。
（2）目前阶段，检验检疫机构和海关联合采取的通关单联网核查系统，所以同时还需校验纸质的通关单据。
（3）这种通关方式不仅加快了通关速度，还有效控制了报检数据与报关数据不符问题的发生，同时能有效遏制不法份子伪造、变造通关证单的不法行为。
电子通关查询相关业务通关状态查询服务采用手机短信点播方式，随时随地为用户提供电子通关业务跟踪信息。用户通过手机将业务特征码发送到10668864，即可获得电子通关业务的处理情况信息。
电子通关联网核查1、基本流程
出入境检验检疫机构根据相关法律法规的规定对法检商品签发通关单，实时将通关单电子数据传输至海关，海关凭以验放法检商品。[1][2]
2、基本要求
“通关单联网核查”的基本要求一是先报检后报关，二是通关单纸质单证信息与通关单电子数据必须一致。即对于按照法律法规规定需要落实检验检疫的进出口货物，必须在检验检疫机构签发通关单，并将通关单电子数据发送到海关，与海关报关单数据进行对碰，通过数据校验之后才能报关。
