海洋及其他环境中可以分离出能够降解琼脂的琼脂糖酶.按照作用方式的不同，可将琼脂糖酶分为α-琼脂糖酶和β-琼脂糖酶两种类型。不同的琼脂糖酶具有不同的生物学特性。琼脂糖酶在海藻单细胞的制备、海藻原生质体的制备、琼脂寡糖的制备、海藻多糖结构的研究及分子生物学研究方面具有重要的应用价值。
β-琼脂糖酶切割琼脂糖亚单位或未置换的新琼脂乙糖（3,6-酐-α-L-吡喃型半乳糖基-1-3-D-半乳糖）生成新琼脂-寡糖（1）。β-琼脂糖酶 I 消化琼脂糖，形成不能再成胶的碳水化合物分子，同时释放所俘获的 DNA。通常残留的碳水化合物分子或 β-琼脂糖酶 I 不会影响随后的限制性内切酶消化、连接反应及转化反应等 DNA 操作。
来源
重组E. coli菌株，此菌株的质粒上携带有β-琼脂糖酶I的基因编码。
反应条件
1X β-琼脂糖酶I反应缓冲液
[10 mM Bis Tris-HCl (pH 6.5), 1 mM Na2EDTA]。42°C温育。
使用注意
琼脂糖：由于在反应温度42°C条件下，溶液必需要呈液态，所以仅低熔点琼脂糖适合于用β-琼脂糖酶I消化。
pH值的敏感性：β-琼脂糖酶I在pH 6.5时有最适酶活力，在pH 5.0-8.5范围内可以保持>75%的酶活力。
对盐的敏感性：NaCl或Na2EDTA浓度在50到500 mM之间不影响β-琼脂糖酶I活性。
