历史传说根
据传说，在公元832年，皮克特王安格斯二世（Angus II）带领皮克特人（Picts）及苏格兰人在东洛锡安的阿瑟斯丹尼福（Athelstaneford）对抗诺桑比亚王国（Kingdom of Northumbria）的盎格鲁人，后来在战斗中处于下风被重重围困。安格斯二世和他的士兵只好祈求上天打救。入夜后，他们突然看见天上的白云在暗蓝的天空中呈X形排列，就觉得是守护圣人圣安德烈在显灵，并保佑他们在战斗中获胜。这令皮克特人及苏格兰人士气大振，而盎格鲁人则丧失斗志，此消彼长下，皮克特军得到了胜利。从此天蓝色底白交叉的图案成为苏格兰国旗。信史根据史料记载，苏格兰国旗要再迟好几百年才被使用。苏格兰国会曾规定士兵穿着有X型图案的军服以方便识别。现存最早采用交叉图案的苏格兰旗是一面1503年的红底白交叉旗。1540年，随着安格斯二世的传说加入了"看见蓝天下的白色X型十字架"这一元素，蓝底白交叉的设计就成为了苏格兰国旗的样式，沿用至今。
样式与尺寸
苏格兰国旗的蓝色背景随着时间不断改变，由较浅的天蓝色至较深的海军蓝都曾采用过，颜色的采用是取决于当时能得到哪种蓝色染料。2003年，苏格兰国会建议政府采用彩通（Pantone） 300作为苏格兰国旗背景蓝色的标准。值得注意的是，联合王国国旗的蓝色背景虽源自苏格兰国旗，但采用的是较深色的Pantone 280，和现行苏格兰国旗并不一样。
国旗尺寸比例并无规定，但普遍使用5:3或3:2，尤以前者较多被采用。交叉的阔度应为旗边高度的五分之一。
苏格兰以外
很多国家或地区的旗帜都采用圣安德鲁十字（Saltire）。苏格兰王詹姆士六世于1603年继承了英格兰王位，自此两国王位合并，所以他后来在1606年把两国的国旗都合并了，把圣安德烈旗和英格兰的圣乔治旗交叠在一起。后来这面旗在1707年联合法案中正式采纳，成为联合王国的国旗。1801年又加入了爱尔兰的圣帕特里克旗，就变成现在的米字旗。
此外，圣安德烈也是俄罗斯的守护圣人
，俄罗斯海军军旗正好是苏格兰国旗的相反（除苏联时期外），呈白底蓝交叉。加拿大新斯科舍省（Nova Scotia，拉丁文：新苏格兰）的旗帜及纹章中也能找到浅蓝色的苏格兰交叉，说明了与苏格兰的渊源。
西班牙加那利群岛的特内里费和哥伦比亚的离岛圣安德列斯（San Andreas）和普罗维登西亚（Providencia）的旗帜样式与苏格兰国旗相同。
另外，国际信号旗代表字母M的旗也是蓝底白交叉。
