生物医学工程研究所2001成立，它的前身是生物医学工程教研室与生物医学工程研究室。教研室成立于1984年，同年由卫生部批准成立了生物医学工程研究室。
本研究所现有人员7名。教师5人（5人获医学、工学硕士学位，其中3人在攻读博士，2人具有硕导资格）；实验技术人员2人（高、中级实验师各1人）。主要从事各层次的计算机、电子学类课程的教学，及医学信号处理、数据库建立与医学电子仪器研制等研究工作。
教学任务：
目前研究所主要承担的教学任务有:
生物医学工程导论 本科生选修课
生物医学信号检测分析：研究生专业课及本科生选修课
医用电子仪器原理：研究生及本科生选修课
医用微机原理及接口技术：研究生专业课及本科生选修课
医学数据处理与SAS软件应用：研究生、本科生选修课
C语言：本专业研究生课程
医学电子学基础：本科影像专业必修课
计算机医学实用技术：研究生选修课
LabWindows CVI 程序设计：研究生专业课
虚拟仪器设计与实现-LabVIEW：研究生专业课
研究生培养工作：
1998年经国家学位委员会批准生物医学工程学位授予点（一级学科），现有硕士生导师2人。已毕业硕士研究生16名（包括10名计算机在生理学研究中的应用专业硕士生），现在读研究生8人。主要培养方向：生物医学信号检测与分析。