南京地铁项目规划工作于1984年启动，先后历经多次调整修改。新确定的南京轨道交通线网规划为14条线，其中10条线为地铁，4条线为轻轨，总长度达到了433公里。目前地铁一号线一期工程已完成建设，2005年5月至8月进行了观光运行，8月12日开始载人模拟试运行，9月3日开始正式试运营。地铁二号线一期工程也于2002年8月经中华人民共和国国务院总理办公会批准立项，2005年12月开工建设试验段，2006年全线开工建设。
工程规划
根据南京市目前城市规划，到2050年南京市的轨道交通线网将由10条地铁线、4条轻轨线构成共计433公里的网络。
1号线：贯穿主城南北中轴线最重要的客流走廊，沿途经迈皋桥、南京火车站、玄武门、鼓楼，穿越新街口中央商务区，向南途经三山街、中华门等车站，再向西接河西新城城市副中心至奥体中心。
2号线：贯穿主城东西中轴线客流走廊，东连仙林大学城，西通河西新城区，中间穿过新街口中央商务区。途经孝陵卫、中山门、明故宫、新街口、汉中门、莫愁路、纬九路等车站。具体走向为: 油坊桥-雨润大街-元通-奥体东-兴隆大街-集庆门大街-云锦路-莫愁湖-汉中门-上海路-新街口-大行宫-西安门-明故宫-苜蓿园-下马坊-孝陵卫-钟灵街-马群-紫金山-仙鹤门-仙鹤中-南师大-仙鹤东-南京大学-体育学院。其中油坊桥-集庆门大街为未来6号线，2号线正线之西延线为奥体中心站-浦口城西路。
3号线：又一条南北客流主干线，贯穿大江南北、连接主城江北新市区和东山新市区，连接禄口机场、南京铁路南站、南京火车站及江北火车站最重要的对外交通枢纽。具体走向为: 九龙湖-天元西路-湖滨路-秦淮路-南京南站-大明路-卡子门-雨花门-长乐路-夫子庙-常府街-大行宫-浮桥-市政府-新庄-南京站-干休所-五塘村-滨江路-浦珠路-京新村-泰冯路-火炬南路-林场
4号线：又一条东西客流主干道，贯穿主城、仙林新市区和江北新市区。具体走向为: 紫金山-仙鹤门-岔路口东-樱花路-省经干院-九华山-市政府-鼓楼-云南路-省委-中保-滨江-浦珠路
5号线：贯穿主城东南和西北的加密线，分流1号线和市中心区的客流量。具体走向为: 下关-盐仓桥-福建路-虹桥-山西路-云南路-五台山-上海路-朝天宫-三山街-夫子庙-大中桥-光华门-小天堂-七桥瓮-大校场-城北路-金箔路-竹山路-科宁路-诚信大道-谭桥-铺岗-苏源大道-将军路
6号线：调整过的6号线大致经过富贵山、明故宫、瑞金路、光华门、大明路、双龙街，然后抵达禄口机场，“今后市民到机场，主城内上车，一票到底，不用转乘，非常方便。”
7号线：是主城两部南北向的预留线，分流南北向主干线的客流量。具体走向为: 尧铁站-田家边-化纤新村-晓庄-窑上村-黄方村-干休所-城河村-福建路-古平岗-省委-莫愁湖-沿河街-应天路-东青石-安德门-宁丹路-共青团路-南京南站-岔路口-河定桥-胜太路-百家湖-小龙湾-竹山路-天印大道-城东路-经贸学院-海事学院-药科大学。目前七号线一期工程（也称一号线南延线）安德门-药科大学段已于2006年开工建设，预计2010年5月建成通车。
8号线：西善桥-汪家村-小行-中华门-雨花门-中和桥-小天堂-胜利村-双拜岗-沧波门。地铁8号线从沧波门地区向东接老宁芜铁路，利用南迁后的老宁芜铁路轨道改造为城市轻轨，经中和桥、中华门、汪家村、西善桥等站点，向西从京沪高速铁路南京长江大桥捆绑过江，然后再向南延伸至桥林新城，形成都市发展区东西向一条新的轨道交通线路。
9号线(轻轨)：南京南站-禄口机场（与南站同步建设，站点尚在规划中）
还有江北轻轨线等等的轻轨线路，预计2050年前建成。
南京市规划到2050年南京市的轨道交通线网将由10条地铁线、四条轻轨线构成共计433公里的网络。预计今后50年内，南京规划轨道交通道路总长度将达到433公里，共设置13条轨道交通，线网密度达到每平方公里0.15公里，与巴黎市相当。主城区有9条轨道交通，总长200公里，主城线网密度为每平方公里0.76公里，与日本名古屋相当，老城区密度为每平方公里1.21公里，与日本大阪相当。预测到2050年，南京的轨道交通平均客流强度将达到2.52万人/公里，轨道交通平均乘距9.5公里。规划实施后，南京中心区地铁车站辐射半径600米，服务人口达95%，在城市范围区内70%人口可在40分钟内到达市中心。
已建成线路南京地铁目前已建成一号线一期工程，并已投入运营。
地铁1号线
南京地铁1号线一期工程南起奥体中心，北至迈皋桥，形成南京主城区中轴线的快速交通走廊。项目投资概算约85亿元，线路全长21.72公里，其中地下线14.33公里，地面线7.49公里，设16座车站（其中地上车站5座：小行站、安德门站、中华门站、红山动物园站和迈皋桥站；地下车站11座：奥体中心站、元通站、中胜站、三山街站、张府园站、新街口站、珠江路站、鼓楼站、玄武门站、新模范马路站和南京站站）。全线设车辆基地一处，位于小行；控制中心一处，位于珠江路。工程于2000年底开工建设，2003年7月1日开始铺轨，2004年7月前实现“轨通”；2004年实现“电通”以及车辆“上线热滑”；2005年5月开始观光运行并逐渐延长观光运行线路长度，8月12日开始模拟试运行，9月3日全线正式建成试运营。2005年8月12日，南京地铁一号线开通试运营，对开的首班车分别于6：28从小行站、6：30于迈皋桥站开出，首日试运营共投入6辆列车，全天开行156车次。 全长21.72公里的南京地铁一号线，工程总投资近85亿元人民币，于2000年12月开始投建，2005年9月3日正式开通运营。地铁一号线的开通，使南京成为继北京、天津、上海、广州、深圳之后，中国大陆第六个拥有地铁的城市。
兴建线路地铁1号线南延线
南京地铁1号线南延线，从安德门站出发，向南途经天隆寺站、宁南大道站、花神庙站、规划中的高铁南京南站、双龙大道站、河定桥站、胜太路站、百家湖站，后折向东经小龙湾站、竹山路站、天印大道站、医大南园站、经贸学院站、南京交院站，最后到中国药大站，全长24.47公里，全线将设15个站。于2006年开工，预计2010年5月建成通车。
地铁2号线
南京地铁2号线一期，西起河西油坊桥，东至马群，全长25.14公里，共设车站19座，其中地下车站18座，高架1座，工程总概算约为104.5亿元。2号线沿途经过新街口、明故宫、孝陵卫、马群、汉中门、莫愁湖、河西等重要地区。地铁2号线已于2002年经中国批准立项，原定于2003年开工，后因宏观调控延期。南京地铁2号线于2005年12月全面开工，预计2010年5月通车运营。其中，二号线将在新街口以及元通两站与一号线交汇。在交汇的站点，将采用站内换乘的方式，使得从一号线转乘二号线无需出站重新购票。
地铁2号线东延线
南京地铁二号线东延线工程，由一期工程马群站沿宁杭公路向东延伸，设金马路站、仙鹤门站、学则路站、学海路站、仙境路东站、南大仙林校区站及经天路站。东延线线路全长12.665km，其中高架线约占全长86.8％；地面线路（含下穿沪宁高速公路路基段涵洞）约占全长13.2％。2007年10月8日开工，预计2010年5月与二号线正线同时通车。
待建线路地铁3号线
地铁三号线是一条南北客流主干线，贯穿大江南北、连接主城江北新市区和东山新市区，连接禄口机场、南京南站、南京火车站及江北火车站最重要的对外交通枢纽。南京召开的三号线建设可行性研究专家论证会，要延长5公里，增加五站，全场39.6公里，共28个站，2009年春节前开工。林场站、火炬南路站、泰冯路站，京新村站、浦珠路站、滨江路站、五塘村站、干休所站、南京站站、新庄站、市政府站、浮桥站、大行宫站、常府街站、夫子庙站、长乐路站、雨花门站、卡子门站、大明路站、站东路站、南京南站站、宏运大道站、秦淮路站、胜太西路站、天元西路站、高湖路站、双龙大道站、吉印大道。就是所延长到九龙湖的。
据介绍，三号线的主控中心将设在南京南站。
单洞双线过江
地铁三号线怎么过江，一直备受关注。昨天，记者从会上获悉，目前已敲定采用盾构隧道的办法穿越长江，双线两条轨道均位于同一个隧道内，即单洞双线过江。据介绍，这个隧道的直径仅比南京过江隧道略微小一点点，直径达11米左右。
地铁6号线
调整过的6号线大致经过富贵山、明故宫、瑞金路、光华门、大明路、双龙街，然后抵达禄口机场
地铁2号线西延线
地铁二号线西延线从奥体中心站沿乐山路向北于兴隆大街路口拐向西并在扬子江大道下、绿博园正门口设置绿博园站；线路出站后穿越夹江、江心洲、长江主干道后进入江北地区。进入江北地区后，线路沿纬七路江北连接线北上，过宁合高速公路后左拐进入浦珠路，沿浦珠路、文德东路、文德西路、城西路向南，在城西路设终点站。西延线全长15.025km，全部为地下线，设车站7座（不含奥体中心站）。其中珠江东站为高架站地面站厅，其余均为地下车站。在终点城西路站设出入线接城西路停车场，并预留向南延伸的条件。在珠江东站附近建主变电所1座。预计2015年前完成。
地铁1号线北延线
从迈皋桥起往北，设4站，分别为：晓庄、吉祥庵、燕子矶、太新路， 全部为高架线路，预计耗资5亿元。随着北延线规划的最新变动，一号线在原来4站的基础上，将再向北延伸3个站，由原来的4站增加到7个站点，直至新港开发区。不过，地铁部门表示，一号线将向北至新港开发区还没有最终定论，目前北延的站点还不能透露。
车资乘坐南京地铁可使用单程票或“公交一卡通”，票价按里程长短分为2、3、4元三等，使用“公交一卡通”的乘客将获得9.5折的优惠，使用“公交一卡通”的学生卡乘客将获得5折的优惠。
南京地铁运营情况南京地铁开通四年来，安全行驶约700万列公里，列车正点率达百分之99.9%以上，至2007年运送乘客2.21亿人次，运营总收入4.45亿元。年日均客流由12.5万人次上升到28万人次，日最高峰客流达到44.77万人次。2008年，南京地铁客流增长迅速，上半年就盈余3000多万元，多于2007年全年的盈余总额近1000万元。
