林口县第三小学始建于1958年，2004年林口铁路小学又合并到第三小学，合并后，一校两址，分居在南山公路两侧，校园绿树成荫，整洁规范，办学成果丰硕。
学校占地面积50272米，学校校舍建筑面积7647平方米，现有36个教学班，5个学前幼儿班。学校建有宿舍楼，为学前儿童班学生和距校远路的学生住宿就餐服务。学校现有教师104人，高级教师5名，中级教师41名，初级教师45名。学生1881人。
学校拥有现代化教学设施条件，电教室、各专用教室齐备。
学校以“全面贯彻教育方针，全面提高教育质量”为办学宗旨，确立了“以人为本、科研兴校、严谨治学、发展特色”的办学思路，形成了一个团结、务实、廉洁、创新的领导集体，造就了一支师德高尚，业务精良的教师队伍，培养了一批批品学兼优、学有所长的学生。
学校坚持以科研为先导，以优化教学过程为主攻方向，以课堂教学为主渠道，以丰富多彩的活动为载体，以提高国民素质为目标，以培养创新人才为核心，引导教师在研究的状态下工作，创造性的教书育人，教育科研成果显著，学校先后获省“双全”学校先进单位，省级德育工作先进单位，“注音识字，提前读写”先进集体和教研中心，多次被评为德育工作、语言工作、体育、卫生工作先进单位，连续多年被评为市“教育工作先进集体”或“教育工作先进单位标兵”，也曾获“市文明单位”、“三八”红旗集体、巾帼建功先进集体、绿色学校、拥军爱民先进单位、家长学校先进集体等荣誉。少先队被评为全国少先队红旗大队。2007年学校被牡丹江市评为特色学校。