美国海军第三舰队成立于１９４３年３月，二战结束后，其番号被撤消。70年代初，美国为了对付前苏联的海上扩张，提高在太平洋的反潜能力，以及加强对中太平洋的控制，美国海军将当时的第一舰队与太平洋舰队反潜司令部合并，恢复了第三舰队的番号。其主要任务是：调指挥太平洋区域的反潜作战，组织反潜防御和训练，保护辖区内航道安全，组织护航兵力，组织新武器装备的海上试验和鉴定。由于第三舰队负责太平洋舰队舰艇兵力的部署前训练，因此，第三舰队曾被称为训练舰队。太平洋舰队新服役的或大修后的舰艇都要先编入该舰队进行训练。训练形式主要是部队演习、战备演习和舰队演习，训练结束后方可派往第七舰队执勤。
第三舰队，其舰队规模远远大于我们熟知的第七舰队，拥有航空母舰5艘，是太平洋舰队的主力。
