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吳耀宗(1893年11月4日-1979年9月17日)，中國基督教三自愛國運動發起人，愛國愛教的典範。
吳耀宗祖籍廣東順德。1893年11月4日生于廣州一個非基督徒木材商人家庭。1913年進入北京稅務學堂。（所以能講一口標准國語）。畢業後在海關供職。1918年受洗加入北京公理會，1920年任北京基督教青年會學校部幹事,組織唯愛社。1924年去美國紐約協和神學院(屬于現代派)及哥倫比亞大學攻讀神學、哲學，獲哲學碩士學位。1927年返國，任職于基督教青年會全國協會出版部。
吳耀宗熱心于抗日愛國運動。抗戰期間就常與重慶之周恩來有所往還。傾向于反蔣、反美。
1949年9月，吳耀宗代表宗教界參加中國人民政治協商會議（雖然並非著名的教會領袖，）。1950年9月參與起草、發表題爲《中國基督教在新中國建設中努力的途徑》的宣言。要求實現自治、自養、自傳，斷絕與海外教會的一切聯系，建設「新中國下的基督教」。1951年，在基督教內開展控訴運動，批判親美人士。這時，原來主要由西方傳教差會支持的各大教派大體上都加入了三自運動，只有一些本土人士建立的教派未加入，如王明道在北京史家胡同建立的基督徒會堂。1952年倪柝聲被捕後，本來贊同三自的各地地方教會又紛紛退出。
1954年，基督教三自愛國運動委員會正式成立，吳耀宗出任主席。未參加三自運動的基督教活動則陸續被禁止。
1966年，文化大革命爆發，「三自愛國教會」也未能幸免，吳耀宗被鬥，接受勞動改造。1979年9月17日在北京去世。
