甘肃农业大学工学院由分别创建于1958年和1976年的机电工程系和水利水电工程系于2003年整建制合并组建而成，是目前甘肃农业大学15个学院中学生规模过千人的四大学院之一。现设农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、农业电气化及其自动化、交通运输、农业水利工程、农业建筑环境与能源工程、水利水电工程7个本科专业和农业机械化、机电工程、汽车运用工程、工程机械、水利水电工程、水文水资源工程6个专科专业，农业机械化工程和农业水土工程两个学科具有硕士学位授予权。
工学院现有教职工60人，专任教师47人，其中教授6人，副教授21人，副研究员1人，讲师、硕士生导师23人；入选甘肃省“333”和“555”“创新人才工程” 3人；在校研究生、本专科学生1053人，成人教育学生900余人；现设有8个教研室，5个仪器设备较为先进的综合实验室，1个教学实习工厂，另外在校外设有5个实践教学实习基地。
工学院经过几代教职员工的不懈努力，形成了以本科教育为主体，积极发展研究生教育，并以专科教育和成人教育为补充的多学科、多层次、多规格的人才培养体系和以教学为主的教学研究型办学格局，已为社会培养上述各专业的高级工程技术人才4000余人，成人教育1500余人，遍布甘肃省乃至全国许多地方的党政机关、教育、科研、工农业生产及其它企事业单位，绝大多数毕业生在自己的工作岗位上兢兢业业，勤奋工作，做出了应有的贡献，不少已成为生产、科研、教育和管理等许多领域的企业家、专家、领导和骨干，赢得了社会的普遍赞誉。
工学院坚持教学与科研、生产相结合，积极开展科学研究，近十多年来，获得省部级科技进步奖11项；省级和省教育厅级教学成果奖6项；主编、参编全国统编及区域性高等院校教材20多部；在国内外学术刊物上发表科学研究和教学研究论文600余篇；获得国家发明和实用新型专利6项，为甘肃省的经济建设和工农业发展做出了重要贡献。
