甘肃农业大学食品科学与工程学院是一个年轻的学院。1988年甘肃农业大学进行专业整合成立食品科学与工程系，1989年开始第一次招生，2004年院系合并后成立食品科学与工程学院。现有在读博士4人，硕士85人，本科生709人；教职工34人，其中在职教授5人，副教授9人，高级实验师1人，讲师5人，助教10人，助理实验师1人。教师获博士学位5人，在职博士7人，硕士15人，在职硕士4人，入选甘肃省“333”人才工程2人、“555”人才工程3人。
学院现有动物性食品营养与工程1个博士学位授权点；农产品加工与贮藏工程、营养与食品卫生学、食品科学和动物性食品营养与工程4个硕士学位授权点；食品加工与安全硕士农业推广专业学位授权点；有食品科学与工程、生物工程、食品质量与安全三个本科专业。
学院建有甘肃省畜产品工程技术研究中心，甘肃省农畜产品加工贮藏重点实验室、果蔬加工省级示范实验室。现设有生物工程、食品科学与工程、食品质量与安全三个系。学院与甘肃省进出口商品检疫检局中心实验室、甘肃莫高葡萄酒业公司等20多家科研院所、企业建立了密切的联系并设立了校外教学科研基地，为研究生和本科生培养及科学研究提供了保障。
建院19年来，办学规模逐渐扩大，师资力量不断增强，教学质量明显提高，科学研究及服务社会的能力得到加强。近年来，学院与美、法、澳、德、日、新西兰等国家及台湾地区十多所院校和科研机构建立了业务往来，与中国科学院及国内大部分省市的农业、轻工等院校建立了科研协作关系。学院已为社会培养了国家任务毕业生793名。自1994年以来开办“食品科学与工程”专业高等教育自学考试应用型辅导班，已培养1300多人。学院已形成了具有博士、硕士、本科多层次的高等教育体系。近年来主持和协作完成国家科学研究项目5项、省部级科学研究项目30项，其中获国家科技进步三等奖1项，甘肃省科技进步等奖11项；在各类学术刊物上发表论文478篇，其中SCI 5篇、EI 5篇、ISTP 2篇，核心刊物、国际会议论文近70多篇。出版各类专著24部，主编、参编教材20部，其中全国统编教材13部。推广科研成果15项，为企业新增产值9000多万元，产生了显著的经济效益和社会效益，为推动甘肃省农产品加工业和食品科技的发展做出了重要的贡献。
