江苏省太湖水质监测中心站前身为“太湖水质监测中心站”，根据江苏省人民政府（苏政复[1980]109号）批复成立于1980年9月25日，设在无锡市，与该市环保监测站合署办公，受省、市环保局双重领导，以市为主，列事业编制二十人；根据2001年10月8日江苏省机构编制委员会办公室（苏编办[2001]221号）文件批复，更名为“江苏省太湖水质监测中心站”，同时将隶属关系改为由江苏省环境保护厅直接管理，人员编制，经费渠道不变。其具体职责是：
1、组织、指导和协调上海市、浙江省以及我省无锡、苏州、常州、镇江等市以及其他行业对太湖水系地区的水质监测、污染源调查等；
2、负责辖区内水质监测资料整理汇编及上级下达的其他任务。