菌源是产生传播体的地方，有传播体才有传播，有传播就有菌源中心(focus)，依照传播距离研究所取的空间规模和菌源中心的形状，菌源可分三类。
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菌源普查病情普查
点源可以是单病斑、单病叶、单病株或一定面积的发病中心等。一般而言，点源的圆形半径不得超过传播距离的1～5%。由于点源所造成的传播比较易于数学处理，目前大多数传播距离的研究试验均采用点源。线源可看作是连续点源的直线集合，线源也有面积，其宽度之半不得超过可能传播距离的1～5%。例如，品种抗病性鉴定圃内一侧的人工接种诱发行对圃内各品种的传播侵染等。区源可看成是密集四向排列的点源的集合，其传播效果是众多点源传播效果的积分。在生产上，发病田对四周无病田成为区源。
菌源普查普查重点地区：甘肃陇南、天水、平凉、庆阳、定西、临夏、甘南；宁夏固原；青海西宁、海东；陕西宝鸡；四川阿坝、甘孜、凉山；云南昆明、曲靖、玉溪、楚雄、大理、丽江；贵州毕节、黔西南、六盘水；河北张家口；山西大同；新疆伊犁、阿克苏等。普查时间：①越夏菌源普查：可在8月下旬或者晚熟冬春麦、自生麦苗等越夏寄主发病盛期进行；②早播秋苗病情普查：可在小麦秋苗期11月下旬至12月上旬进行。
普查内容：①越夏菌源普查：调查晚熟冬春麦、自生麦苗越夏寄主面积、范围和条锈病发生情况；观察发病区域地势地貌，记录海拔高度、经纬度等；记录田间7月下旬至8月上旬平均气温，观测记录当地风力、风向等气象情况；调查晚熟冬春麦和自身麦苗与早播秋苗衔接程度等。调查方法参照《小麦条锈病测报调查规范》（GB/T15795-1995）有关越夏区调查的要求进行，结果分别记入表1、表2和表6。
②早播秋苗病情普查：重点调查小麦不同品种、不同播期、不同海拔高度（间隔100米）种植面积及条锈病发生情况（包括发病中心/单片病叶密度、病田率、普遍率、严重度等）。调查田块的确定和调查方法参照《小麦条锈病测报调查规范》有关秋苗期病情普查的要求进行，调查结果记入表3。
越夏菌源系统调查
调查重点地区：甘肃文县、武都、天水市麦积区、甘谷、平凉市崆峒区、庆阳市宁县、临洮、康乐；宁夏彭阳、固原；青海循化、民和、互助；陕西陇县；四川黑水、松潘、茂县；贵州赫章、盘县、兴义；云南永胜、红塔、保山、楚雄、威信；河北张家口；山西大同；新疆伊犁、阿克苏等。
调查内容：①晚熟冬春麦生长后期病情消长动态；②自生麦苗夏秋季病情消长动态；③早播秋苗秋冬季病情消长动态。
调查时间：以晚熟小麦、自生麦苗和早播秋苗为重点，开展定时定点系统调查。自生麦苗和早播秋苗在出苗后选择不同海拔（可间隔100-200米）.
病情普查普查重点地区：四川绵阳、广元、温江、雅安、成都、遂宁、资阳；重庆开县、合川、潼南、丰都；
菌源
贵州毕节、黔西南、六盘水；云南楚雄、玉溪、曲靖、德宏、文山、昆明、保山、玉溪；陕西汉中、安康、商洛；湖北襄樊、十堰；河南南阳、信阳；山东菏泽、济宁；安徽阜阳等。普查时间：在小麦秋苗和返青拔节期各进行一次普查。秋苗普查一般在每年12月中、下旬，春季普查一般在3月上、中旬。
普查内容：小麦品种布局、播期、生育期、发病始期、病田率、亩病叶数、平均严重度，地理生态条件及温、雨、露、雾、雪等气候条件。调查方法参照《小麦条锈病测报调查规范》有关病情普查的要求进行，结果记入表3。
调查重点地区：四川梓潼、射洪、雅安、资中、阆中；重庆开县、合川、潼南、丰都；贵州赫章、思南、盘县、兴义；云南昆明、玉溪、大理、保山；陕西宁强、安康汉滨区、眉县、周至；湖北谷城、南漳、宜城、郧西、京山；河南淅川、信阳平桥区；山东成武、济宁；安徽阜阳等。
调查内容：小麦条锈病在秋、冬、春季消长情况及菌源扩散蔓延情况；温度、雨露雾等气候条件。调查方法参照《小麦条锈病测报调查规范》有关病情发展系统调查的要求进行。调查时，记录田间平均气温、降水、日照、结雾（露）日和冬季气温、积雪、封冻等气象条件。有条件地区，利用孢子捕捉仪，定期探测空中夏孢子有无及其数量消长动态。调查结果记入表5和表6。
