中山大学港澳珠江三角洲研究中心（以下简称“中心”）是教育部人文社会科学百所重点研究基地之一，它是一个跨学科的综合性研究机构，研究方向主要包括港澳珠三角区域经济研究、港澳珠三角区域法律与政治研究及港澳珠三角社会文化与教育研究，研究领域涉及经济学、政治学、管理学、法学、社会学、人文地理学和教育学等。2004年，中心被列入教育部“985”二期工程中山大学港澳研究哲学社会科学创新基地。中山大学人文社会科学的多学科优势支撑了中心的发展，而研究基地的科研平台和研究课题带动了相关学科发展。
中心按照教育部关于建设人文社科重点研究基地和教育部“985”二期工程港澳研究哲学社会科学创新基地的要求，不断深化科研体制的改革，逐步形成机构开放、人员流动、内外联合、竞争创新、“产学研”一体化的运行机制，努力将中心建设成为港澳珠三角领域的科学研究、人才培养、学术交流和资料信息以及咨询服务的中心，充分发挥研究中心在本领域的“思想库”、“信息库”和“人才库”的作用。